Note ABES Experimental study of the kinetics of two systems : DNA complexation by the NCp7 protein and probe dynamics in a glassy colloidal suspension Etude expérimentale de cinétique de deux systèmes : complexation de l'ADN par la protéine NCp7 et dynamique d'une suspension colloïdale vitreuse NCp7 Laponite Single molecule Real time Optical tweezers Optical trap TIRFM Total internal reflection fluorescence microscopy 541.34 Cinétique chimique Complexation ADN Absorption et adsorption Viscoélasticité Dans la première partie de cette thèse, nous étudions la cinétique de la complexation d'un double brin d'ADN par la protéine NCp7. Pour ce faire, nous étudions l'évolution des propriétés mécaniques de l'ADN au fur et à mesure de sa complexation, en étirant la complexe ADN/NCp7 à l'aide d'un montage de piégeage optique. Nous avons observé que la longueur de persistance du complexe diminue au fur et à mesure de la complexation. En utilisant un modèle statistique décrivant l'évolution de la flexibilité de l'ADN complexé par NCp7. Notre principal résultat est que la fraction//phi de paires de bases ayant réagi n'est pas une fonction linéaire du temps aux faibles //phi. Nous interprétons nos résultats en supposant que l'adsorption de NCp7 sur l'ADN est fortement coopérative. Dans deuxième chapitre, nous décrivons la dynamique de particules sondes dans une suspension vitreuse colloïdale de Laponite. La Laponite est une particule colloïdale discoïdale de 25nm de diamètre et de 0.92 nm d'épaisseur. Nous utilisons une expérience de microscopie en onde évanescente, et suivons le mouvement de particules fluorescentes de latex. Nous imageons ensuite ces particules. Nous montrons que, pour un mouvement possédant une seule échelle de temps caractéristique, elle est simplement une fonction linéaire du temps. Nous obtenons que, quelle que soit leur taille, le mouvement des particules sondes peut être décrit par une succession de deux modes dynamiques, où le mode le plus rapide correspond à la diffusion des particules dans un fluide viscoélastique. In the first part of this thesis, we study the kinetics of the complexation of a double-stranded DNA byNCp7 protein. To do this, we study the evolution of mechanical properties of DNA and its complexation by stretching the DNA/NCp7 complex with a optical trap. We observed that the persistence length of the complex decreases progressively during the complexation. Using astatistical model we describe the evolution of the flexibility of DNA complexed with NCp7. Our main result is that the fraction phi of base pairs that have reacted is not a linear function of time at low phi.We interpret our results assuming that the adsorption of NCp7 on DNA is highly cooperative. In the second chapter, we describe the dynamics of probe particles in a colloidal glassy suspension of Laponite. Laponite is a colloidal discoidal particle of 25 nm in diameter and 0.92 nm thick. We take advantage of evanescent wave microscopy, and follow the movement of fluorescent latex particles.Then we image these particles. We show that for a movement that has a single characteristic time scale, it is simply a linear function of time. We find that, what ever their size, the motion of probe particles can be described by a succession of two dynamic modes, where the fastest mode corresponds to the diffusion of particles in a viscoelastic fluid. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 4213767 Université de Strasbourg Strasbourg 2013-12-31 https://theses.hal.science/tel-00858886 application/pdf 4318347 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2012/klajner_piotr_2012_ED182.pdf http://www.theses.fr/2012STRAE002/abes https://theses.hal.science/tel-00858886 https://theses.hal.science/tel-00858886 https://theses.hal.science/tel-00858886 https://theses.hal.science/tel-00858886 Klajner Piotr 1983-11-20 FR 164712259 40615669 https://theses.fr/2012STRAE002 2012STRAE002 https://doi.org/10.70675/78f8988azb950z4559z90fez35839e5bf55c 2012-05-11 Chimie physique Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Münch Jean-Pierre MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 075478935 Hebraud Pascal MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 130815616 Turek Philippe MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 077771796 Chatenay Didier MADS_RAPPORTEUR_1 032188277 Freyssingeas 19..-.... Eric MADS_RAPPORTEUR_2 110147618 École doctorale Physique et chimie-physique (Strasbourg ; 1994-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 PH 156500019 Institut de physique et chimie des matériaux (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 151842973 93794 ddc:540 Münch Jean-Pierre Hebraud Pascal Turek Philippe Chatenay Didier Freyssingeas Eric École doctorale Physique et chimie-physique (Strasbourg ; 1994-....) Institut de physique et chimie des matériaux (Strasbourg) PDF 4213767