Note ABES Investigations moléculaires dans la mort subite du sujet de moins de 35 ans Molecular investigations of sudden cardiac death in people younger than 35 years Mort subite Cannalopathies RyR2 KCNQ1 High resolution melting Spectrométrie de masse MALDI-TOF Prélèvements fixés au formol inclus en paraffine Sudden death Channelopathies RyR2 KCNQ1 High resolution melting Mass spectrometry MALDITOF Formalin-fixed and paraffin-embedded 572.8 616.1 Mort subite Myocarde -- Maladies Génétique Séquençage des acides nucléiques Les canalopathies cardiaques congénitales constituent la principale hypothèse diagnostique dans les cas de mort subite inexpliquée chez les sujets de moins de 35 ans. Notre travail a eu pour objectif demettre au point une stratégie de détection post-mortem des mutations sur les gènes connus pour être impliqués dans les canalopathies cardiaques, applicable en routine, à partir de la principale source d’ADN post-mortem disponible en France à savoir les prélèvements fixés au formol et inclus en paraffine (FFIP). A partir d’une cohorte de 12 cas, deux techniques de détection de variants génétiques ont été évaluées, une technique de criblage par l’analyse des courbes de fusion haute résolution et une technique de génotypage par spectrométrie de masse MALDI-TOF, respectivement sur le gène KCNQ1 et le gène RyR2. Quelle que soit la technique utilisée, il n’est pas possible de s’affranchir du séquençage de type Sanger afin d’explorer les séquences d’intérêts qui n’ont pu être optimisées avec l’une ou l’autre des méthodes à la fois sur les prélèvements congelés et FFIP. L’arrivée des séquenceurs de nouvelles générations ouvrent ainsi de nouvelles perspectives dans ce domaine. The congenital cardiac channelopathies constitute the principal diagnostic hypothesis in autopsynegative sudden unexplained death concerning people younger than 35 years old. The present study aimed to develop a strategy of mutations detection on known genes implicated in the cardiac channelopathies. This strategy of mutations detection had to be applicable to routine and has been studied on formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) tissues which are the principal DNA source available in France. On a cohort of 12 cases, two technique of sequence variants detection wereevaluated: the screening method of High Resolution Melt and the genotyping method based on a MALDI-TOF mass spectrometry, respectively on KCNQ1 and RyR2 genes. Whatever the technique, there is a necessity of resorting to the Sanger sequencing to explore the sequence of interest none optimized with one or the other technology both on FFEP and frozen tissues. That’s why the next generation sequencing method should open new perspectives in the post-mortem diagnostic of cardiac channelopathies. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 11826767 Université de Strasbourg Strasbourg 2013-12-31 https://theses.hal.science/tel-00804339 application/pdf 11680984 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2012/Farrugia-Jacamon_Audrey_2012_ED414.pdf http://www.theses.fr/2012STRAJ074/abes https://theses.hal.science/tel-00804339 https://theses.hal.science/tel-00804339 https://theses.hal.science/tel-00804339 Farrugia-Jacamon Audrey 1978-09-14 FR 168256541 40305104 https://theses.fr/2012STRAJ074 2012STRAJ074 https://doi.org/10.70675/62164345zb3e5z4e27z988cz87b231132cec 2012-12-05 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Ludes Bertrand MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 031424996 Rouge Daniel MADS_PRESIDENT_DU_JURY Mensah-Nyagan Guy MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 Carracedo Angel MADS_RAPPORTEUR_1 Chevalier Philippe MADS_RAPPORTEUR_2 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Physiopathologie et médecine translationnelle (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 EA 4438 157666581 136980 ddc:570 ddc:610 Ludes Bertrand Rouge Daniel Mensah-Nyagan Guy Carracedo Angel Chevalier Philippe École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Physiopathologie et médecine translationnelle (Strasbourg) PDF 11826767