Note ABES Applications de la spectrométrie de masse type MALDI-TOF à la bactériologie et à la distinction de variants génétiques Applications of MALDI-TOF mass spectrometry to the bacteriology and to the distinction between genetics variants Spectrométrie de masse MALDI-TOF Bactériologie Hémocultures Typage bactérien Identification bactérienne Epidémiologie MALDIBiotyperTM Microorganismes Mass spectrometry MALDI-TOF Blood cultures Bacteriology Bacterial typing Bacterial identification Epidemiology MALDIBiotyperTM Microorganisms 572.8 579.3 616.904 Bactéries pathogènes Classification Spectrométrie de masse Phénotype Protéomique Épidémiologie moléculaire Résistance aux antibiotiques Spectrométrie de masse MALDI Dissertations universitaires Techniques de typage bactérien Dissertations universitaires L’objectif de mon travail fut de valider et d’optimiser la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF pour l’identification et la classification d'un ensemble de bactéries pathogènes ou opportunistes chez l’homme, en enrichissant une base de données et en testant la robustesse de la méthode, afin d’obtenir une méthode rapide fixe et fiable d'acquisition de résultats. Les différents résultats obtenus ont permis la validation de la technique comme outil d’identification bactérienne fiable en routine. Elle permet désormais de caractériser les mélanges de deux bactéries voir même la différentiation d’espèces très proches comme les Shigella spp et E. coli. Nous avons montré que la technique sera encore améliorée par un outil supplémentaire de comparaison des souches pour une veille épidémiologique "en temps réel", sans investissement supplémentaire, en permettant plusieurs types d'économie. Elle apporte un gain réel dans la prise en charge du patient et le choix éclairé des antibiotiques testés pour l'antibiogramme. La technique peut aussi constituer un outil alternatif de sérotypage. The aim of this work was to validate and optimize MALDI-TOF mass spectrometry for the identification and classification of a set of pathogens or opportunistic bacteria, by enriching a database and testing the robustness of the method, in order to obtain a quick and reliable fixed acquisition results. The different results obtained allowed the validation of the technique as a reliable tool for bacterial identification in hospital routine. In addition, we have shown that it can characterize mixtures of two bacteria and differentiate closely related species such as Shigella spp and E. coli. We demonstrate that MALDI-TOF/MS will be further enhanced by an additional tool for comparison of strains for epidemiological monitoring in "real time". The technique can also be an alternative tool for serotyping. MALDI-TOF/MS identification provides a real benefit in terms of patient care and the choice of antibiotics tested for sensitivity, without additional investment, which allows different types of economy. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 12346857 Université de Strasbourg Strasbourg 2013-12-31 https://theses.hal.science/tel-00872251 application/pdf 12404081 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2012/Moussaoui_Louardi_2012_ED414.pdf http://www.theses.fr/2012STRAJ124/abes https://theses.hal.science/tel-00872251 https://theses.hal.science/tel-00872251 https://theses.hal.science/tel-00872251 Moussaoui Louardi 1978-09-29 FR 172271770 40304242 https://theses.fr/2012STRAJ124 2012STRAJ124 https://doi.org/10.70675/8d342db3z135ez45e4z9589zc28e47355919 2012-09-05 Recherche clinique et innovation technologique Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Prévost Gilles MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 034102639 Riegel Philippe MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 172264804 André Philippe MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 Lozniewski Alain MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 Megraud Francis MADS_RAPPORTEUR_1 Greub Gilbert MADS_RAPPORTEUR_2 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Physiopathologie et médecine translationnelle (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 EA 4438 157666581 136980 ddc:570 ddc:610 Prevost Gilles Riegel Philippe André Philippe Lozniewski Alain Megraud Francis Greub Gilbert École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Physiopathologie et médecine translationnelle (Strasbourg) PDF 12346857 confidentialité 2012-09-05 2013-09-05 confidentialité 2012-09-05 2013-09-05 restriction 2012-09-05 2013-09-01 confidentialité 2012-09-05 2013-09-05 confidentialité 2012-09-05 2013-09-05