Recherche de biomarqueurs d'exposition et d'effet à des cancérigènes de l'environnement par spectrométrie de masse
Characterization of exposure and effect biomarkers to environmental carcinogens by mass spectrometry
Benzo(a)pyrène
Benzo(e)pyrène
Biomarqueurs
Cancer
Sécrétome
Protéomique
Quantification label-free
Spectrométrie de masse
Benzo(a)pyrene
Benzo(e)pyrene
Biomarkers
Cancer
Secretome
Proteomics
Label-free quantification
Mass spectrometry
572.6
616.99
Marqueurs biologiques
Composés aromatiques polycycliques
Protéomique
Cancérogènes
Spectrométrie de masse
Le Benzo(a)pyrène (BaP), appartenant à la famille des hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) est cancérigène pour l’homme. Nous avons développé une approche protéomique quantitative nanoLC-MS/MS label-free pour identifier des biomarqueurs liés à l’exposition au BaP dans le sécrétome des cellules hépatiques humaines exposées au BaP vs. des cellules non exposées et exposées au Benzo(e)pyrène (BeP). Le BeP, agent non classifié comme cancérigène pour l’homme, est choisi comme contrôle négatif afin de distinguer les protéines spécifiques du BaP de celles des HAP. 847 protéines ont été identifiées et quantifiées, et 55 ont été fortement surexprimées avec un ratio supérieur à 5 : la plupart de ces protéinessurexprimées sont précoces et liées au cancer. Une validation ultérieure de l'expression de ces protéines dans le plasma de la population exposée au BaP aidera dans le développement de biomarqueurs qui permettront d'améliorer la détection précoce, le pronostic et prévention.
Benzo(a)pyrene (BaP) belongs to a class of polycyclic aromatic hydrocarbon and is reported as a potent human carcinogen. We performed a nanoLC-MS/MS-based label-free quantitative proteomics approach to identify potential biomarkers of exposure in the secretome of BaPtreated vs. non-treated and Benzo(e)pyrene (BeP)-treated human hepatoma cell line HepG2.BeP-treated cells were chosen as a negative control to distinguish the BaP-specific from the HAP-specific regulated proteins: BeP is not classifiable as to its carcinogenicity to humans. 847 proteins have been identified and quantified and 55 proteins were seen as being highly upregulated with a fold change of at least 5. Most of these up-regulated proteins were focused incancer-related activities. Further validation of expression of these proteins in the plasma of BaP-exposed population will assist in the development of biomarkers that will greatly improve early detection, prognosis, prediction of treatment response and prevention.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
fr
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11087521
Université de Strasbourg
Strasbourg
2014-12-31
https://theses.hal.science/tel-01018695
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11083357
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Ibrahim
Marianne
1987-05-28
LB
17643710X
21017178
https://theses.fr/2013STRAF038
2013STRAF038
https://doi.org/10.70675/18db5f81zef85z412ez9547z133bb9ead37d
2013-12-05
Chimie biologique et thérapeutique
Strasbourg
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Université Libanaise
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08401430X
Doctorat
Docteur es
non
oui
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Emmanuelle
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1
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Chahine
Ramez
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Ferro
Myriam
MADS_RAPPORTEUR_2
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École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
MADS_ECOLE_DOCTORALE_1
CH
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Chimie de la matière complexe (Strasbourg)
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ddc:570
ddc:610
Université libanaise
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École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
Chimie de la matière complexe (Strasbourg)
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