Note ABES Rôle et mode d'action de l'UTP : RNA Uridylyltransférase URT1 dans l'uridylation et la dégradation des ARNm chez Aradopsis thaliana Role and mechanism of the UTP : RNA Uridylyltransferase URT1 in mRNA’s uridylation and degradation in Arabidopsis thaliana Dégradation des ARN Uridylation Uridylyltransférase Granules de stress Arabidopsis thaliana RNA degradation Processing bodies Uridylyltransferase Stress granules Arabidopsis thaliana 572.8 Nucléotidyltransférases ARN messagers Transcription génétique Arabidopsis thaliana La dégradation des ARN est un mécanisme essentiel à la régulation de l’expression des génomes. L’importance de l’uridylation dans les mécanismes de dégradation des ARN commence juste à être appréciée. Cette thèse présente l’étudede l’UTP :RNA Uridylyltransferase 1 (URT1) et de son rôle dans la dégradation des ARN chez Arabidopsis thaliana. L’étude des propriétés catalytiques de URT1 montre que cette uridylyltransférase est intrinsèquement spécifique des UTP et distributive pour les premières uridines ajoutées. URT1 est responsable in vivo de l’uridylation des ARNm après une étape de déadénylation, protégeant leur extrémité 3’ et polarisant la dégradation de 5’ en 3’. URT1 est localisée dans le cytosol au niveau des granules de stress et des processing bodies. Le mécanisme d’adressage de URT1 dans les processing bodies implique une partie de la région N terminale prédite comme intrinsèquement désorganisée, alors que le domainenucléotidyltransférase C terminal semble suffisant pour permettre l’adressage de URT1 au niveau des processing bodies et granules de stress en réponse à un stress thermique. Ces travaux de thèse ont permis de mieux comprendre les mécanismes et les rôles de l’uridylation dans la dégradation des ARNm chez Arabidopsis. Ils ouvrent des perspectives dans l’étude d’autres fonctions de l’uridylation comme l’inhibition de la traduction. RNA degradation is an essential mechanism for the regulation of genome expression. The importance of uridylation for RNA degradation is just emerging. This thesis presents the study of URT1 (UTP :RNA Uridylyltransferase 1) and its role in RNA degradation in Arabidopsis thaliana. URT1 is an uridylyltransferase intrinsically and strictly specific for UTP and is distributive for the first nucleotides added. URT1 uridylates mRNA in vivo after a deadenylation step. This uridylation protects mRNA’s3’ end from further attacks and polarise degradation in the 5’ to 3’ direction. This protection of 3’ ends by uridylation and its conferred polarity of 5’ to 3’ degradation are also detected in polysomes. Uridylation is therefore likely important in case of cotranslational degradation of mRNAs. A region in URT1’s N terminal region predicted to be intrinsically disorganised is required for addressing URT1 to processing bodies. However, following heat shock, the nucleotidyltransferase domain present in the C terminal region of URT1 is sufficient to address URT1 to both processing bodies and stress granules, This work contributes to a better understanding of the mechanisms and roles of uridylation in RNA degradation in Arabidopsis thaliana. These results also open perspectives for studying other functions of uridylation such as translation inhibition. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 19673566 Université de Strasbourg Strasbourg 2015-12-31 https://theses.hal.science/tel-01124203 https://theses.hal.science/tel-01124203 application/pdf 57008788 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2013/ferrier_emilie_2013_ED414.pdf http://www.theses.fr/2013STRAJ053/abes https://theses.hal.science/tel-01124203 https://theses.hal.science/tel-01124203 Ferrier Emilie Ferrier 1985-10-02 FR 176374957 21015419 https://theses.fr/2013STRAJ053 2013STRAJ053 https://doi.org/10.70675/e8ba5074z8e90z42abzb103z67a05a0120ff 2013-11-29 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Gagliardi Dominique MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 129248444 Pfeffer Sébastien MADS_PRESIDENT_DU_JURY 069221928 Saez-Vasquez Julio MADS_RAPPORTEUR_1 115881522 Weil Dominique MADS_RAPPORTEUR_2 155155059 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 444 156775727 ddc:570 Gagliardi Dominique Pfeffer Sébastien Saez-Vasquez Julio Weil Dominique École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 19673566 restriction 2013-11-29 2015-01-01 restriction 2013-11-29 2015-01-01