Note ABES The antiviral siRNA interactome in Drosophila melanogaster L'interactome antivirale de la voie des siARNs de Drosophila melanogaster SiARN Virus Hôte pathogène Drosophile ARNi SiRNA Virus Host-pathogen Drosophila RNAi 572.8 ARN interférence Protéomique Facteurs de transcription Drosophila melanogaster Réponse immunitaire Régulation de l'expression des gènes viraux Dissertations universitaires La voie de l’ARN interférence (ARNi), en particulier celle des siRNA, constitue la défense antivirale majeure chez les plantes,les nématodes et les insectes. Le génome de l’organisme modèle Drosophila melanogaster code pour trois protéines, Dcr-­‐2, AGO2 et R2D2, indispensables à cette voie. Les mouches mutantes pour une de ces trois protéines sont plus susceptibles et succombent plus rapidement aux infections virales comparées aux mouches sauvages. Beaucoup d’études biochimiques ont permis d’obtenir une image assez précise de la fonction moléculaire de ces trois protéines in vitro. Cependant, plusieurs études in vivo ont révélé une réalité plus complexe, probablement liée à l’association de ces molécules avec des cofacteurs. Ce manuscrit décrit les approches adoptées afin d’identifier les partenaires protéiques de la voie des siRNA et d’étudier leurs rôles, notamment dans un contexte infectieux. Dcr-­‐2, AGO2 et R2D2 ont été étiquetés par génie génétique avec un tag de 16 acides aminés, reconnu par la biotin-­‐ligase BirA, qui permet leur biotinylation après leurs transfections dans les cellules S2. Les cellules transfectées ont été ensuite soumises à différentes infections virales,notamment avec le virus C de la Drosophile (DCV) (Dicistroviridae), le virus de la stomatite vésiculaire (VSV) (Rhabdoviridae) ou le Flock House virus (FHV) (Nodaviridae). Les cellules ont été ensuite lysées au pic de l’infection et les complexes protéiques purifiés et analysés par spectrométrie de masse.[...] Fighting viral infections is hampered by the scarcity of viral targets and their variability resulting in development of resistance. Viruses depend on cellular molecules for their life cycle, which are attractive alternative targets, provided that they are dispensable for normal cell fonctions. Using the mode! organism Drosophila melanogaster, we identify the ribosomal protein RACK1 as a cellular factor required for infection by the internai ribosome entry site (IRES) containing virus Drosophila C virus (DCV). We further demonstrate that inhibition of RACK1 in human liver cells impairs hepatitis C virus (HCV) IRES-mediated translation and infection. Inhibition of RACK1 in Drosophila and hurnan cells does not affect cell viability and proliferation, and RACK1-silenced adult flies are viable, indicating that this protein is not essential for general translation. Our findings demonstrate a specific function for ribosomal protein RACK 1 in selective mRNA translation and uncover a promising targe! for the development of broad antiviral intervention. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 10955831 Université de Strasbourg Strasbourg 2015-12-31 https://theses.hal.science/tel-01136213 application/pdf 48706784 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2013/MAJZOUB_Karim_2013_ED414.pdf http://www.theses.fr/2013STRAJ075/abes https://theses.hal.science/tel-01136213 https://theses.hal.science/tel-01136213 https://theses.hal.science/tel-01136213 Majzoub Karim 1985-02-19 LB 176982833 40505081 https://theses.fr/2013STRAJ075 2013STRAJ075 https://doi.org/10.70675/2247d0e6z5b7dz4d94zb038z9cb679aff3dc 2013-09-23 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Imler Jean-Luc MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 033866074 Westhof Eric MADS_PRESIDENT_DU_JURY 071323813 Miska Éric MADS_RAPPORTEUR_1 184551927 Benkirane Monsef MADS_RAPPORTEUR_2 070127131 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 UPR 9022 157771342 470 ddc:570 Imler Jean-Luc Westhof Eric Miska Éric Benkirane Monsef École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Réponse immunitaire et développement chez les insectes (Strasbourg) PDF 10955831