Note ABES Caractérisation métabolomique des tissus épilectogènes par spectroscopie RMN à haute résolution à l'angle magique (RMN HRMAS) : applications à l'épilepsie temporale humaine et animale Metabolomic profile of cerebral biopsies in temporal lobe epilepsy (TLE) using High Resolution Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy at Magic Angle Spinning (HRMAS NMR) : applications to human and animal model of TLE. Epilepsie temporale Résonance magnétique nucléaire Angle magique Métabolomique Microondes Neurométabolisme Carbone 13 Lithium-pilocaprine Temporal Lobe Epilepsy Nuclear Magnetic Resonance Magic Angle Spinning Metabolomic Lithium-pilocarpine Carbon 13 572.4 616.85 Épilepsie temporale Histopathologie Spectroscopie de la résonance magnétique nucléaire Épilepsie temporale Aspect moléculaire Métabolomique La métabolomique a pour objet l’identification et la quantification de métabolites dans un échantillon biologique. Cette discipline s’inscrit dans une approche du vivant connue sous le terme de « biologie des systèmes ». La spectroscopie par résonance magnétique nucléaire haute résolution à l’angle magique (RMN HRMAS) est une méthode de choix pour l’obtention de ce type de profilage métabolique. L’épilepsie du lobe temporal (ELT) est une épilepsie focale fréquente associée le plus souvent à des pertes neuronales sélectives, une gliose réactionnelle et une plasticité cellulaire spécifique. Bien que restant débattue, une origine neurométabolique reste un axe de recherche majeur. A ce jour une caractérisation métabolomique des tissus épileptogènes par RMN HRMAS reste à effectuer. Notre travail a consisté dans un premier temps à caractériser, chez le rat, les effets des méthodes de prélèvement et de fixation sur le métabolome cérébral dans le cadre des acquisitions RMN HRMAS. Dans un second temps, nous avons travaillé sur le modèle animal lithium-pilocarpine d’ELT. Nous avons pu décrire le métabolome issu des données RMN 1H HRMAS de différentes structures cérébrales impliquéesdans l’épileptogénèse. Des analyses multivariées de type PLS-DA ont pu mettre en évidence des profils métaboliques pathologiques au sein du cortex entorhinal et de l’hippocampe. A l’aide de substrats marqués au carbone 13 ([1-13C]glucose et de [1,2-13C]acétate) nous avons étudié les voies métaboliques neuronales et gliales. Nos résultats suggèrent l’absence d’anomalies métaboliques au sein des astrocytes. Enfin dans un dernier temps, nous avons effectué des analyses RMN 1H HRMAS sur près de 200 échantillons cérébraux de patients atteints d’ELT. Une analyse multivariée a permis de distinguer les profils métaboliques des hippocampes sclérosés et non sclérosés. En revanche la construction de modèles sur la base d’hypothèses clinico métaboliques (durée de la maladie, fréquence de crises, antécédents de convulsions fébriles) n’a pas permis d’identifier de profils métaboliques spécifiques. L’ensemble de ces données suggère l’existence de profils métabolomiques distincts en fonction des caractéristiques neuropathologiques des patients atteints d’ELT. Notre travail confirme la nécessité d’une approche intégrée de type « biologie des systèmes » pour l’étude de l’ELT aussi bien chez l’homme que dans des modèles animaux. Metabolomics relates to the identification and quantification of metabolites in biological samples. This discipline is part of an approach known under the term of "systems biology". High Resolution Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy at Magic Angle Spinning (HRMAS NMR) is a method for obtaining metabolic profiling in such sample. Temporal Lobe Epilepsy (TLE ) is a common focal epilepsy often associated with selective neuronal loss, reactive gliosis and specific cellular plasticity. A neurometabolic origin of this epilepsy is a major area of research. To date no characterization of human cerebral biopsy from TLE patients has been conducted using HRMAS NMR. In the present work we aimed first at characterizing, in rats, the effects of sampling methods and fixation on brain metabolome under HRMAS NMR acquisitions. In a second step, we studied the lithium-pilocarpine model of TLE. In this model, we could describe the metabolome from HRMAS 1H NMR data of different brain structures involved in epileptogenesis. Multivariate analysis could highlight pathological metabolic profiles in the entorhinal cortex and hippocampus. Using substrates labeled with carbon 13 ( [1 -13C ]-glucose and [1,2-13C ]-acetate) we studied neuronal and glial metabolic pathways. Our results suggest the absence of metabolic abnormalities in astrocytes metabolism as previously reported. Finally, we conducted HRMAS 1H NMR analysis in nearly 200 brain samples from TLEpatients. Multivariate analysis was able to distinguish metabolic profiles between sclerotic and non sclerotic hippocampi. However mutlivariate models based on clinico- metabolic assumptions (disease duration, frequency of seizures, history of febrile seizures ) did not identify specific metabolic profile. All these data suggest the existence of distinct metabolomic profile based on neuropathological features of patients with TLE. Our work confirm the need of an integrated approach such as " systems biology" for the study of TLE in humans as long as in animal models. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 15966576 Université de Strasbourg Strasbourg 2015-12-31 https://theses.hal.science/tel-01148768 https://theses.hal.science/tel-01148768 application/pdf 15846110 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2013/Detour_Julien_2013_ED414.pdf http://www.theses.fr/2013STRAJ098/abes https://theses.hal.science/tel-01148768 https://theses.hal.science/tel-01148768 https://theses.hal.science/tel-01148768 Detour Julien 1977-03-07 FR 092791964 49904847 https://theses.fr/2013STRAJ098 2013STRAJ098 https://doi.org/10.70675/24120faczf374z4bffzb69cz20876e4b95b3 2013-10-02 Sciences de la vie et de la santé Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Namer Izzie Jacques MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 073314609 Nehlig Astrid MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 078658586 Sandner Guy MADS_PRESIDENT_DU_JURY 034158820 Devaux Bertrand MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 057688729 Ryvlin Philippe MADS_RAPPORTEUR_1 060148381 Caldarelli Stefano MADS_RAPPORTEUR_2 081378750 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 176969721 217648 ddc:570 ddc:610 Namer Izzie Jacques Nehlig Astrid Sandner Guy Devaux Bertrand Ryvlin Philippe Caldarelli Stefano École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg) PDF 15966576