Note ABES Chromatin structure and DNA repair Etude de la structure de la chromatine dans la réparation de I'ADN Réponse aux dommages de l’ADN Cassure double brin Réparation de l’ADN PICh Recombinaison homologue Stress réplicatif SET TAF-Iβ DNA damage response Double strand break DNA repair PICh Homologous recombination Replication stress SET TAF-Iβ 572.8 ADN -- Réparation Chromatine Protéomique Recombinaison génétique Protéines oncogènes Dissertations universitaires Notre génome est continuellement endommagé par des agents provoquant des lésions de l’ADN. Les cassures doubles brins de l’ADN (CDBs) sont les lésions les plus dangereuses. En effet, une CDB mal réparée peut mener à des aberrations de l’ADN pouvant conduire à l’apparition d’un cancer. Dans le but d’éviter les effets délétères des CDBs, nos cellules ont développé une voie de signalisation, nommée réponse aux dommages de l’ADN (RDA), permettant la détection des cassures et l’activation des points de contrôle du cycle cellulaire afin d’arrêter le cycle pendant la réparation des CDBs. Une des caractéristiques principales de la RDA est l’accumulation d’un grand nombre de facteurs sur l’ADN autour de la cassure, formant un foyer visible en microscopie. Cependant, l’efficacité de réparation de l’ADN est entravée par la structure condensée de la chromatine environnante. Les mécanismes de réparation de l’ADN surmontent ce problème en recrutant de nombreuses protéines permettant le réarrangement de la chromatine afin de faciliter la réparation. Le but de mon travail de thèse est d’identifier de nouvelles protéines impliquées dans le remodelage de la chromatine autour des CDBs. D’une part nous avons pour but d’identifier le protéome complet d’un foyer de réparation de l’ADN grâce à la technique PICh (Proteomics of Isolated Chromatin loci). D’autre part, nous étudions le rôle de l’oncoprotéine SET/TAF-1β, que nous avons identifié lors d’un criblage siRNA réalisé dans le but de découvrir de nouveaux facteurs chromatiniens impliqués dans la réparation des CDBs. Various DNA damaging agents, that can cause DNA lesions, assault constantly our genome. The most deleterious DNA lesions are the breaks occurring in both strands of DNA (Double stand breaks: DSBs). Inefficient repair of DSBs can lead to aberrations that may induce cancer. To avoid these deleterious effects of DSBs, cells have developed signalling cascades which entail detection of the lesions and spreading of the signal that leads to arrest in cell cycle progression and efficient repair. A major characteristic of DNA damage response (DDR) is the accumulation of a vast amount of proteins around the DSBs that are visible in the cell as DNA damage foci. However, efficient DNA repair is hampered by the fact that genomic DNA is packaged into chromatin. The DNA repair machinery overcomes this condensed structure to access damaged DNA by recruiting many proteins that remodel chromatin to facilitate efficient repair. The aim of my PhD work is to identify novel proteinsinvolved in the DDR and/or the remodelling of chromatin surrounding DSBs. On one hand, we take advantage of the PICh (Proteomics of Isolated Chromatin loci) technique and we aim to identify the entire proteome of DNA repair foci. On the other hand, we study the role of the oncogene SET/TAFIβ, a major hit of a siRNA screen performed to identify novel chromatin related proteins that play role in repair of DSBs. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 7667948 Université de Strasbourg Strasbourg 2015-12-31 https://theses.hal.science/tel-01165075 application/pdf 85297638 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2013/Hoffbeck_Anne-Sophie_2013_ED414.pdf http://www.theses.fr/2013STRAJ104/abes https://theses.hal.science/tel-01165075 https://theses.hal.science/tel-01165075 https://theses.hal.science/tel-01165075 Hoffbeck Anne-Sophie 1986-02-04 FR 177882298 40300904 https://theses.fr/2013STRAJ104 2013STRAJ104 https://doi.org/10.70675/ab1412f8zbddbz4ed2z8999zbb37db7c920a 2013-10-25 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Soutoglou Evi MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 17788312X Reina-San-Martin Bernardo MADS_PRESIDENT_DU_JURY 158368010 Schreiber Valérie MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 076534235 Sardet Claude MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 088004740 Papamarcaki Thomais MADS_RAPPORTEUR_1 185416314 Cammas Florence MADS_RAPPORTEUR_2 138944814 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 UMR_S964 155263749 93800 ddc:570 Soutoglou Evi Reina-San-Martin Bernardo Schreiber Valérie Sardet Claude Papamarcaki Thomais Cammas Florence École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 7667948 confidentialité 2013-10-25 2015-06-01 confidentialité 2013-10-25 2015-06-01 confidentialité 2013-10-25 2015-06-01 confidentialité 2013-10-25 2015-06-01