Modélisation de phénomènes biologiques complexes : application à l'étude de la réponse antigénique de lymphocytes B sains et tumoraux
Modeling complex biological phenomena : application to the study of the antigenic response of healthy and tumor B lymphocytes
Réseaux de gènes
Régression Lasso
Biologie des systèmes complexes
Gene regulatory network
Lasso Regression
Systems biology
572.8
004
Biologie systémique
Variabilité génétique
Modèles mathématiques
Programmation génétique (informatique)
Analyse de régression
Antigènes tumoraux
Leucémie chronique lymphocytaire à cellules B
Dissertations universitaires
Réseaux de régulation génique
Dissertations universitaires
La biologie des systèmes complexes est le cadre idéal pour l'interdisciplinarité. Dans cette thèse, les modèles et les théories statistiques répondent aux modèles et aux expérimentations biologiques. Nous nous sommes intéressés au cas particulier de la leucémie lymphoïde chronique à cellules B, qui est une forme de cancer des cellules du sang. Nous avons commencé par modéliser le programme génique tumoral sous-jacent à cette maladie et nous l'avons comparé au programme génique d'individus sains. Pour ce faire, nous avons introduit la notion de réseau en cascade. Nous avons ensuite démontré notre capacité à contrôler ce système complexe, en prédisant mathématiquement les effets d'une expérience d'intervention consistant à inhiber l'expression d'un gène. Cette thèse s'achève sur la perspective d'une modulation orientée, c'est-à-dire le choix d'expériences d'intervention permettant de « reprogrammer » le programme génique tumoral vers un état normal.
System biology is a well-suited context for interdisciplinary. In this thesis, statistical models and theories closely meet biological models and experiments. We focused on a specific complex system model: the chronic B-cell chronic lymphocytic leukemia disease which is a cancer of the blood cells. We started by modeling the genetic program which underlies this disease and we compared it to the healthy one. This conduced us to introduce the concept of cascade networks. We then showed our ability to control this complex system by predicting with our mathematical model the effects of a gene inhibition experiment. This thesis ends with the perspective of oriented modulation, i.e. targeted interventional experiments on genes allowing to “reprogram” the cancerous genetic program toward a healthy normal state.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
fr
en
PDF
10112934
Université de Strasbourg
Strasbourg
2016-12-31
https://theses.hal.science/tel-02392352
application/pdf
8481844
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2014/Jung_Nicolas_2014_ED414.pdf
http://www.theses.fr/2014STRAJ067/abes
https://theses.hal.science/tel-02392352
https://theses.hal.science/tel-02392352
https://theses.hal.science/tel-02392352
https://theses.hal.science/tel-02392352
Jung
Nicolas
1988-12-24
FR
190866136
40607368
https://theses.fr/2014STRAJ067
2014STRAJ067
https://doi.org/10.70675/2c19d6abzbe4az48aezaeb8zbb454adb09ba
2014-12-03
Biologie des systèmes
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Bahram
Seiamak
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1
079509339
Georgel
Philippe
MADS_PRESIDENT_DU_JURY
160451914
Thiébaut
Rodolphe
MADS_MEMBRE_DU_JURY_1
071580735
Maumy
Myriam
MADS_MEMBRE_DU_JURY_2
050228439
Guermeur
Yann
MADS_RAPPORTEUR_1
143028871
Auffray
Charles
MADS_RAPPORTEUR_2
034829121
École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
MADS_ECOLE_DOCTORALE_1
VS
156502844
Immunorhumatologie moléculaire (Strasbourg)
MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1
UMRS1109
175164703
222993
ddc:570
ddc:004
Bahram
Seiamak
Georgel
Philippe
Thiébaut
Rodolphe
Maumy-Bertrand
Myriam
Guermeur
Yann
Auffray
Charles
École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Immunorhumatologie moléculaire (Strasbourg)
PDF
10112934
restriction 2014-12-03 2019-12-03
restriction 2014-12-03 2019-12-03