Native chemical ligation for the design of dynamic covalent peptides
Ligation chimique native réversible pour la conception de peptides covalents dynamiques
Peptides
Chimie combinatoire dynamique
Liaison réversible
Ligation chimique native
Peptides
Dynamic combinatorial chemistry
Reversible bond
Native chemical ligation
547.7
Lipides
Réactions chimiques
Liaisons covalentes
Glycopeptides
Chimie combinatoire
Utiliser la liaison peptidique dans des systèmes dynamiques covalents est très difficile en raison de sa stabilité intrinsèque. Dans ce travail, une nouvelle méthodologie pour échanger fragments peptidiques dans des conditions biocompatibles est décrite. Légères modifications du groupe amine d'un résidu de cystéine en peptides modèle permettent l'activation spécifique de cette jonction peptidique pour des réactions d'échange covalent. Grâce à un mécanisme de ligation chimique native réversible, fragments peptidiques sont échangés en solution aqueuse à pH physiologique et en présence de dithiothréitol (DTT), avec des demi-temps d'équilibration de 2 à 10 heures. Différentes possibles applications biologiques de cette nouvelle réaction réversible à peptides et glycopeptides sont aussi proposées.
The possibility to use the peptide bond in dynamic covalent systems is very challenging because of its intrinsic stability. In this work, a novel methodology to exchange peptide fragments in bio-compatible conditions is described. The introduction of small modifications to the N-terminus of a cysteine residue in model peptides allows for the specific activation of that peptide bond for exchange reactions. Through a reverse Native Chemical Ligation (NCL) mechanism, peptide fragments were scrambled in aqueous solution at physiological pH and in the presence of dithiothreitol (DTT), with half-times of equilibration in the 2-10 h range. Additionally, possible biological applications of this new reversible reaction to both peptides and glycopeptides are proposed.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
en
PDF
28653170
Université de Strasbourg
Strasbourg
2016-12-31
https://theses.hal.science/tel-01688394
application/pdf
28545450
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2015/Garavini_Valentina_2015_ED222.pdf
http://www.theses.fr/2015STRAF053/abes
https://theses.hal.science/tel-01688394
https://theses.hal.science/tel-01688394
https://theses.hal.science/tel-01688394
https://theses.hal.science/tel-01688394
Garavini
Valentina
1986-07-29
IT
191578002
21120123
https://theses.fr/2015STRAF053
2015STRAF053
https://doi.org/10.70675/af395c4bzba60z4919zbde8z75ac6555e5a2
2015-09-28
Chimie
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Giuseppone
Nicolas
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1
157784479
Wagner
Alain
MADS_PRESIDENT_DU_JURY
127880518
Barboiu
Mihai
MADS_RAPPORTEUR_1
112244602
Vincent
Stéphane
MADS_RAPPORTEUR_2
183847954
École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
MADS_ECOLE_DOCTORALE_1
CH
156504081
Institut Charles Sadron (Strasbourg ; 1985-....)
MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1
167
156774062
ddc:540
Giuseppone
Nicolas
Wagner
Alain
Barboiu
Mihai
Vincent
Stéphane
École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg)
Institut Charles Sadron (Strasbourg)
PDF
28653170
confidentialité 2015-09-28 2018-01-01
confidentialité 2015-09-28 2018-01-01
restriction 2015-09-28 2018-01-01
confidentialité 2015-09-28 2018-01-01
confidentialité 2015-09-28 2018-01-01