MyGeneFriends : vers un nouveau rapport entre chercheurs et mégadonnées
MyGeneFriends : towards a new relationship between researchers and big data
Génomique
Réseaux sociaux
Maladies
Personnalisation
Infrastructure web
Mégadonnées
Genomics
Social networks
Diseases
Personalisation
Web framework
Bigdata
005.7
572.8
616
Données massives
Web usage mining
Analyse des données -- Logiciels
Génomique comparative
Information génétique
Ces dernières années, la biologie a subi une profonde mutation, impulsée notamment par les technologies à haut débit et la montée de la génomique personnalisée. L’augmentation massive et constante de l’information biologique qui en résulte offre de nouvelles opportunités pour comprendre la fonction et l’évolution des gènes et génomes à différentes échelles et leurs rôles dans les maladies humaines. Ma thèse s’est articulée autour de la relation entre chercheurs et information biologique, et j’ai contribué à (OrthoInspector) ou créé (Parsec, MyGeneFriends) des systèmes permettant aux chercheurs d’accéder, analyser, visualiser, filtrer et annoter en temps réel l’énorme quantité de données disponibles à l’ère post génomique. MyGeneFriends est un premier pas dans une direction passionnante, faire en sorte que ce ne soient plus les chercheurs qui aillent vers l’information, mais que l’information pertinente aille vers les chercheurs sous une forme adaptée, permettant l’accès personnalisé et efficace aux grandes quantités d’informations, la visualisation deces informations et leur interconnexion en réseaux.
In recent years, biology has undergone a profound evolution, mainly due to high through put technologies and the rise of personal genomics. The resulting constant and massive increase of biological data offers unprecedented opportunities to decipher the function and evolution of genes and genomes at different scales and their roles in human diseases. My thesis addressed the relationship between researchers and biological information, and I contributed to (OrthoInspector) or created (Parsec, MyGeneFriends) systems allowing researchers to access, analyze, visualize, filter and annotate in real time the enormous quantity of data available in the post genomic era. MyGeneFriends is a first step in an exciting new direction: where researchers no longer search forinformation, but instead pertinent information is brought to researchers in a suitable form, allowing personalized and efficient access to large amounts of information, visualization of this information,and their integration in networks.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
fr
PDF
9414856
Université de Strasbourg
Strasbourg
2016-12-31
https://theses.hal.science/tel-01379315
application/pdf
7176360
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2015/Allot_Alexis_2015_ED414.pdf
http://www.theses.fr/2015STRAJ058/abes
https://theses.hal.science/tel-01379315
https://theses.hal.science/tel-01379315
https://theses.hal.science/tel-01379315
https://theses.hal.science/tel-01379315
Allot
Alexis
1986-04-25
FR
195639545
40500539
https://theses.fr/2015STRAJ058
2015STRAJ058
https://doi.org/10.70675/c29caa22ze325z4273z9047zad5d2bcb5aa8
2015-10-09
Bioinformatique et biologie des systèmes
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Lecompte
Odile
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Poch
Olivier
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Gançarski
Pierre
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Vallar
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Chalmel
Frédéric
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École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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VS
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Odile
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École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg)
Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg)
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9414856