Note ABES Amélioration et développement de méthodes de sélection du nombre de composantes et de prédicteurs significatifs pour une régression PLS et certaines de ses extensions à l'aide du bootstrap lmprovement and development of selection methods for both the number of components and significant predictors for a PLS regression and some extensions with bootstrap techniques Régression PLS Bootstrap Composantes Puces à ADN Sélection de variable PLS regression Bootstrap Components Microarray Variable selection 519.5 572.8 Génomique Méthodes statistiques Étude d'association pangénomique Variabilité génétique Analyse de régression Bootstrap (statistique) Moindres carrés Théorie de l'estimation La régression Partial Least Squares (PLS), de part ses caractéristiques, est devenue une méthodologie statistique de choix pour le traitement de jeux de données issus d’études génomiques. La fiabilité de la régression PLS et de certaines de ses extensions repose, entre autres, sur une détermination robuste d’un hyperparamètre, le nombre de composantes. Une telle détermination reste un objectif important à ce jour, aucun critère existant ne pouvant être considéré comme globalement satisfaisant. Nous avons ainsi élaboré un nouveau critère de choix pour la sélection du nombre de composantes PLS basé sur la technique du bootstrap et caractérisé notamment par une forte stabilité. Nous avons ensuite pu l’adapter et l’utiliser à des fins de développement et d’amélioration de procédés de sélection de prédicteurs significatifs, ouvrant ainsi la voie à une identification rendue plus fiable et robuste des probe sets impliqués dans la caractéristique étudiée d’une pathologie. The Partial Least Squares (PLS) regression, through its properties, has become a versatile statistic methodology for the analysis of genomic datasets.The reliability of the PLS regression and some of its extensions relies on a robust determination of a tuning parameter, the number of components. Such a determination is still a major aim since no existing criterion could be considered as a global benchmark one in the state-of-art literature. We developed a new bootstrap based stopping criterion in PLS components construction that guarantee a high level of stability. We then adapted and used it to develop and improve variable selection processes, allowing a more reliable and robust determination of significant probe sets related to the studied feature of a pathology. Electronic Thesis or Dissertation Text fr en PDF 4220591 Université de Strasbourg Strasbourg 2016-12-31 https://theses.hal.science/tel-01394602 application/pdf 8322387 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2015/Magnanensi_Jeremy_2015_ED414.pdf http://www.theses.fr/2015STRAJ082/abes https://theses.hal.science/tel-01394602 https://theses.hal.science/tel-01394602 https://theses.hal.science/tel-01394602 https://theses.hal.science/tel-01394602 Magnanensi Jérémy 1987-11-19 FR 196406854 40502270 https://theses.fr/2015STRAJ082 2015STRAJ082 https://doi.org/10.70675/7c8488fdzd2b5z4c86z877dzef94efbef1d7 2015-12-18 Biostatistique Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Meyer Nicolas MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 125099193 Esposito Vinzi Vincenzo MADS_PRESIDENT_DU_JURY 121489280 Esposito Vinzi Vincenzo MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 121489280 Bertrand Frédéric MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 128458585 Guenot Dominique MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 072650966 Sabatier Robert MADS_RAPPORTEUR_1 069516871 Hanafi Mohamed MADS_RAPPORTEUR_2 177828315 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Progression tumorale et micro-environnement. Approches translationnelles et épidémiologie (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 176973990 245026 Institut de recherche mathématique avancée (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_2 026571641 93707 ddc:510 ddc:570 Meyer Nicolas Esposito Vinzi Vincenzo Esposito Vinzi Vincenzo Bertrand Frédéric Guenot Dominique Sabatier Robert Hanafi Mohamed École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Progression tumorale et micro-environnement. Approches translationnelles et épidémiologie (Strasbourg) Institut de recherche mathématique avancée (Strasbourg) PDF 4220591