Dispositif de discrimination entre des micro-organismes et leur environnement pour une détection précoce
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 30/01/2021.
 
Auteur : Bouthillon, Marine
Date de soutenance : 29-01-2016

Directeur(s) de thèse : Collet, Christophe - Takakura, Yoshitate

Président : Burel, Gilles
Rapporteur(s) : Burel, Gilles - Stolz, Christophe

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
École doctorale : École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....)
 
Discipline : Image et vision
Classification : Informatique, Sciences de l'ingénieur, Médecine et santé

Mots-clés libres : Détection de contaminants, Microbiologie, Mesure 3D, Triangulation à LED, Mesure de dissimilarité, Classification, Apprentissage
Mots-clés :
  • Industrie pharmaceutique -- Qualité -- Contrôle
  • Dispositifs médicaux stériles
  • Microbiologie sanitaire
  • Microorganismes -- Analyse
  • Traitement d'images -- Techniques numériques
Résumé : Cette thèse consiste en la conception d'un système d'acquisition et d'un algorithme de traitement d'image. Le but de ce travail est la détection de contaminants dans un contexte de contrôle qualité, particulièrement dans l'industrie pharmaceutique. Les contaminants sont des colonies de micro-organismes se développant sur membrane micro-poreuse. Nous avons choisi d'utiliser la mesure tridimensionnelle de surface pour réaliser l'acquisition des données, ce qui n'a jamais été fait pour des données micro-biologiques. Notre apport a de plus consisté à remplacer l'éclairage laser généralement utilisé par un dispositif à LED permettant de réduire le bruit dans les données. Cela permet de diminuer la durée d'incubation des tests de 14 jours à moins de 5. Concernant l'algorithme, nous avons analysé les données de hauteur en combinant une méthode de détection de données aberrantes et un séparateur à vaste marge. La difficulté de la détection réside dans la variété des signaux correspondant aux colonies, et également dans la présence d'artefacts semblables aux colonies. Nous sommes capables de détecter correctement la présence ou l'absence de contaminants dans 98% des cas.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2016STRAD005
Type de ressource : Thèse