Contribution à l'estimation de la similarité dans un ensemble de projections tomographiques non-orientées
Langue Français
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Auteur : Phan, Minh-Son
Date de soutenance : 07-10-2016

Directeur(s) de thèse : Tajine, Mohamed

Président : Schultz, Patrick
Rapporteur(s) : Ritchie, David - Normand, Nicolas
Membre(s) du jury : Jonic, Slavica - Schreck, Pascal

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
École doctorale : École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....)
 
Discipline : Informatique
Classification : Informatique, Mathématiques

Mots-clés libres : Cryo-microscopie électronique, Reconstruction tomographique, Distance euclidienne, Différence angulaire, Orientations inconnues, Moments de projections, Graphe de voisinage
Mots-clés :
  • Cryomicroscopie
  • Tomographie (mathématiques)
  • Graphes d'intersections, Théorie des
  • Projection (géométrie)
  • Moment angulaire
  • Tomographie en microscopie électronique - Dissertations universitaires
Résumé : La cryo-microscopie électronique est une technique tomographique permettant de reconstituer la structure 3D d’un objet complexe en biologie à partir d’un jeu d’acquisitions. Ces images de l’objet complexe sont appelées les projections et sont acquises sous orientations inconnues. Un des avantages de la cryo-microscopie électronique est l’obtention d’un modèle 3D de très haute résolution de l’objet dans un état naturel. La procédure de reconstruction comporte plusieurs étapes telles que l’alignement, la classification des projections, l’estimation de leurs orientations et le raffinement des projections. Lors de ces étapes, la distance entre deux projections est fréquemment mesurée. Le travail réalisé au cours de cette thèse s’organise autour de la recherche théorique d’une distance entre des projections non-orientées avec comme objectif l’amélioration de la procédure de reconstruction tomographique en cryo-microscopie électronique. La contribution de ce travail de thèse est une méthode permettant d’estimer la différence angulaire entre deux projections dans les cas 2D et 3D. Notre méthode est basée sur la construction d’un graphe de voisinage dont les sommets sont les projections, dont les arêtes relient des projections voisines et sont pondérées par une approximation locale de la différence angulaire. Le calcul de ces poids repose sur les propriétés des moments de projection. Notre méthode est testée sur des images simulées de différentes résolutions et de différents niveaux du bruit. La comparaison avec des autres méthodes d’estimation de la différence angulaire est aussi réalisée.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2016STRAD041
Type de ressource : Thèse