Note ABES Alignement-reconstruction simultanée de tomogramme électronique et extraction de volume de ribosome Simultaneous alignment-reconstruction of electronic tomogram and 3D extraction of ribosome Tomographie électronique Orientations erronées Optimisation 3D Analyse multifractale Intégration fractionnaire Electronic Tomography Incorrect Orientations Optimization 3D Multi-fractal analysis Fractional integration 006.6 571.6 Ribosomes Microbiologie Imagerie tridimensionnelle en biologie Traitement d'images -- Techniques numériques Analyse fractale Microscopie électronique en transmission Ce travail de thèse aborde le problème de l'alignement d'images 2D obtenues en tomographie électronique dans la perspective d'une reconstruction tridimensionnelle et la détection des ribosomes à partir de l'objet reconstruit. Une méthode d'optimisation globale est proposée pour minimiser un coût qui permet d'effectuer l'alignement 3D et la reconstruction de manière conjointe. La thèse traite également le problème de la segmentation des images 3D reconstruites avec une méthode de classification probabiliste. Cependant, la nature des images de cryo-tomographie révèle des problèmes de bruit et de contraste. Deux méthodes de filtrage 3D ont été proposées comme prétraitement du processus de segmentation. La première méthode est basée sur l'intégration fractionnaire. La seconde est basée sur l'analyse multi-fractale. L'institut de recherche biomédicale IGBMC de Strasbourg a fourni les images de projection utilisées dans cette thèse. This thesis deals with the problem of the alignment of 2D images obtained by transmission electron microscopy in the perspective of a three-dimensional reconstruction and the detection of ribosomes from the reconstructed object. A global optimization method is proposed to minimize a cost that allows the 3D alignment and reconstruction to be carried out jointly. The thesis also deals with the problem of segmentation of reconstructed 3D images with a probabilistic classification method. However, the nature of cryo-tomography images reveals noise and contrast problems. For this reason, two methods of 3D filtering have been proposed as pre-processing of segmentation, one is based on fractional integration, and the other on a multi-fractal analysis. The institute of biomedical research IGBMC in Strasbourg provides the projection images used in this thesis. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 7979556 Université de Strasbourg Strasbourg 2017-12-31 https://theses.hal.science/tel-01552672 application/pdf 4729265 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2016/Rojbani_Hmida_2016_ED269.pdf http://www.theses.fr/2016STRAD045/abes https://theses.hal.science/tel-01552672 https://theses.hal.science/tel-01552672 https://theses.hal.science/tel-01552672 Rojbani Hmida 1986-11-27 DE 202739163 21317701 https://theses.fr/2016STRAD045 2016STRAD045 https://doi.org/10.70675/0278fb53z06e7z49eez8d3cz90a7b61da718 2016-11-28 Informatique Strasbourg 131056549 Université de Tunis El-Manar. Faculté des Sciences de Tunis (Tunisie) MADS_ETABLISSEMENT_DE_COTUTELLE_1 081796994 Doctorat Docteur es non oui Ronse Christian MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 06885966X Bsaïes Khaled MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 13329997X Sellami-Masmoudi Dorra MADS_PRESIDENT_DU_JURY 143799762 Farah Imed Riadh MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 162325428 Hamouda Atef MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 031169791 Baudrier Etienne MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 103882685 Sellami-Masmoudi Dorra MADS_RAPPORTEUR_1 143799762 Passat Nicolas MADS_RAPPORTEUR_2 101512821 Kervrann Charles MADS_RAPPORTEUR_3 103581162 École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 MA 156504863 Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 UMR7357 176969721 260728 ddc:004 ddc:570 Université de Tunis El-Manar. Faculté des Sciences de Tunis (Tunisie) Ronse Christian Bsaïes Khaled Sellami-Masmoudi Dorra Farah Imed Riadh Hamouda Atef Baudrier Etienne Sellami-Masmoudi Dorra Passat Nicolas Kervrann Charles École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg) Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg) PDF 7979556