Etudes in silico et expérimentale de la DXR & synthèse de D- et L-GAP énantiomériquement purs
Langue Français
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Modalités de diffusion de la thèse :
  • Thèse confidentielle jusqu'au 22/12/2017.
  • Thèse soumise à l'embargo de l'auteur jusqu'au 22/12/2017 (communication intranet).
 
Auteur : Krebs, Fanny
Date de soutenance : 21-12-2016

Directeur(s) de thèse : Grosdemange-Billiard, Catherine - Stote, Roland

Président : Tarnus, Céline
Rapporteur(s) : Michielin, Olivier - Pelligrini-Moïse, Nadia
Membre(s) du jury : Prévost, Martine

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de chimie (Strasbourg ; 2005-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : MEP, DXR, Modélisation moléculaire, MM/PBSA, Docking, GAP, Dynamique moléculaire
Mots-clés :
  • Enzymes
  • Dynamique moléculaire
  • Simulation de docking moléculaire
  • Inhibiteurs
Résumé : La thèse porte sur l’étude des 2 premières enzymes de la voie du MEP: la DXS et DXR. La voie du MEP conduit à la biosynthèse des isoprénoïdes chez la plupart des bactéries, dont des pathogènes. Etant absente chez l’homme, les enzymes de cette voie cible idéale pour la recherche de nouveaux antimicrobiens. L’objectif principal était d’améliorer le développement de nouveaux antimicrobiens. Nous avons utilisé des outils computationnels : méthodes de docking et de mécanique moléculaire couplée à la méthode MM/PBSA. Nous avons identifié les résidus contribuant significativement à la fixation d’un ligand dans le site actif de la DXR. Ces résultats ont été utilisés lors de la conception de nouveaux candidats inhibiteurs de type bisubstrat, biligand et difluoro phosphonate, dont 2 ont pu être synthétisés. Nous avons également développé une méthode de synthèse donnant accès au L- et D-GAP énantiomeriquement purs, dans le but d’étudier l’énantiospécificité de la DXS face à son substrat D-GAP.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2016STRAF059
Type de ressource : Thèse