Identification des circuits biologiques induits par le virus de l'hépatite C et leurs implications dans le développement du carcinome hepatocellulaire
Unraveling Hepatitis C virus-induced biological circuits contributing to the development of hepatocellular carcinoma
Virus de l’hépatite C
Carcinome hépatocellulaire
Maladie hépatique
Signalisation cellulaire
Phosphatase
PTPRD
Hepatitis C virus
Hepatocellular carcinoma
Liver disease
Cell signalling
Phosphatase
PTPRD
579.2
572.8
616.3
Virus de l'hépatite C
Métabolisme
Carcinome hépatocellulaire
Tyrosine phosphatase
Protéines virales
Relations hôte-virus
En combinant un nouveau système de culture cellulaire à partir d'hépatocytes différenciés avec du virus de l’hépatite C (VHC) purifié, nous pouvons induire un profil transcriptomique caractéristique des patients à risque élevé de développer un carcinome hépatocellulaire (CHC). En utilisant ce modèle, nous avons découvert le rôle fonctionnel de l'EGFR comme élément moteur de la signature du risque de développement d'un CHC. De plus, nous avons identifié des gènes candidats impliqués dans le développement du CHC. Pour étudier les maladies du foie in vivo, nous avons caractérisé l'expression des protéines phosphatases dans des biopsies hépatiques de patients infectés par le VHC. Nous avons observé une régulation négative de PTPRD, un suppresseur de tumeur, causé par une augmentation de miR-135a-5p qui cible l'ARNm de PTPRD. Par ailleurs, l'analyse in silico montre que l'expression de PTPRD dans le tissu hépatique est corrélée à la survie chez les patients atteints de CHC.
By combining a cell culture system of hepatocyte-like cells with purified hepatitis C virus (HCV), we effectively simulated chronic infection in vitro. We found this infection model induces a transcriptomic profile of chronic HCV patients at high risk of developing hepatocellular carcinoma (HCC). Using this model, we have uncovered the functional role of EGFR as a driver of the HCC risk signature and revealed candidate drivers of the molecular recalibration of hepatocytes leading to liver cancer. In an approach to study liver disease in vivo, we opted to screen for protein phosphatase expression in liver biopsies of chronic HCV patients. We observed a downregulation of PTPRD, a well-known tumor suppressor. We demonstrated that this effect is mediated by an increase in miR-135a-5p which targets PTPRD mRNA. Moreover, in silico analysis shows that PTPRD expression in adjacent liver tissue of HCC patients correlates with survival and reduced tumor recurrence after surgical resection.
Electronic Thesis or Dissertation
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9471078
Université de Strasbourg
Strasbourg
2016-12-31
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https://theses.hal.science/tel-01823837
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Van Renne
Nicolaas
1983-10-18
BE
196732913
21219522
https://theses.fr/2016STRAJ015
2016STRAJ015
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2016-04-19
Virologie : aspects moléculaires et médicaux
Strasbourg
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Doctorat
Docteur es
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112222609
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École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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Institute for Translational Medicine and Liver Disease (Strasbourg ; 201X-....)
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Neumann-Haefelin
Christoph
École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Interactions virus-hôte et maladies hépatiques (Strasbourg)
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