Note ABES Comprendre la flexibilité génétique de la protéine d’enveloppe de VIH-1 à travers l’étude du réseau de coévolution de ses acides aminés Understanding the genetic flexibility of the HIV-1 envelope protein through the study of the network of its coevolving amino acids VIH-1 Glycoprotéine d’enveloppe Réseau de coévolution Fonctionnalité HIV-1 Envelope glycoprotein Coevolution network Functionality 572.8 616.97 VIH (virus) Glycoprotéine 120 Recombinaison génétique Coévolution Protéine d'enveloppe gp120 du VIH Dissertations universitaires Protéine d'enveloppe gp160 du VIH Dissertations universitaires Une des caractéristiques du Virus de l’Immunodéficience Humaine de type 1 (VIH-1) est sa diversification génétique extensive, qui lui permet d’échapper au système immunitaire. Néanmoins, il est nécessaire que le taux de mutation requis pour à cette évolution rapide ne compromette pas la fonctionnalité de ses protéines. Les travaux présentés ici ont eu pour objectif l’étude des réseaux de coévolution qui composent les glycoprotéines d’enveloppe (Env) afin de comprendre les règles qui sous-tendent leur évolution. Il a été mis en évidence que les régions variables de ces protéines, grâce à leur flexibilité structurelle, peuvent aussi servir à faciliter l’incorporation de mutations touchant les régions plus constantes. De plus, un réseau de coévolution impliqué dans les changements de conformations nécessaires à l’activité de Env a été identifié, soutenant le fait que ces régions variables ont un rôle central dans ces changements. Ces études démontrent le rôle crucial joué par les régions variables en dévoilant un nouvel aspect de leur contribution à l’évolution du VIH-1. The Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) is characterized by an extensive genetic diversification of its strains that allows the virus to escape the immune system. However, the mutation rate needed for this rapid evolution must not compromise the functionality of the viral proteins. The aim of the work presented here has been to study the coevolution networks that constitute the envelope glycoproteins (Env) in order to understand the rules driving their evolution. The results have highlighted that variable regions, thanks to their structural freedom, can facilitate the incorporation of mutations in more constant regions. Moreover, a coevolution network involved in the conformational changes required for the activity of Env has been identified, underlining the central role played by variable regions in these processes. Besides underscoring the crucial role played by variable regions in the functionality of Env, these studies unveil a new aspect of their contribution to HIV-1 evolution. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 3477860 Université de Strasbourg Strasbourg 2017-12-31 https://theses.hal.science/tel-01492958 application/pdf 6342302 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2016/Gasser_Romain_2016_ED414.pdf http://www.theses.fr/2016STRAJ026/abes https://theses.hal.science/tel-01492958 https://theses.hal.science/tel-01492958 https://theses.hal.science/tel-01492958 https://theses.hal.science/tel-01492958 Gasser Romain 1989-12-02 FR 199476527 40713065 https://theses.fr/2016STRAJ026 2016STRAJ026 https://doi.org/10.70675/4b5ed6bezeddez492fza5ffza2d33e824f98 2016-06-13 Virologie : aspects moléculaires et médicaux Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Negroni Matteo MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 136869025 Moog Christiane MADS_PRESIDENT_DU_JURY 074287788 Amara Ali MADS_RAPPORTEUR_1 150233108 Braibant Martine MADS_RAPPORTEUR_2 164245278 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 ddc:610 Negroni Matteo Moog Christiane Amara Ali Braibant Martine École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg) PDF 3477860