Note ABES Rôle de la protéine p14 du BNYVV et de l'ARN-3 viral dans la suppression de l'interférence par l'ARN et le mouvement à longue distance Role of the BNYVV-p14 protein and the viral RNA-3 in the RNA silencing suppression and the long distance movement ARN non codant viral Exoribonucléases BNYVV RNA silencing Mouvement systémique Viral noncoding RNA Exoribonucleases BNYVV RNA silencing Systemic movement 579.2 572.8 Phytovirus Cytogénétique Betterave à sucre Viroses Protéine p14 TCL1 Virus à ARN positif Protéines virales ARN non codants Le beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) est un phytovirus qui possède un génome segmenté à ARN de polarité positive. L’ARN3 viral renferme le domaine « core » qui contient une séquence de 20 nucléotides appelée « coremin », indispensable au mouvement systémique du virus chez Beta macrocarpa. L’ARN3 subit un processus de dégradation qui conduit à la formation d’un ARN non codant (ncRNA3) correspondant à son extrémité 3’. Ce dernier est stabilisé par la séquence « coremin » à son extrémité 5’. Grâce à l’outil génétique levure, l’exoribonucléase Xrn1 puis l’exoribonucléase XRN4 de plante ont été identifiées comme étant responsable de l’accumulation du ncRNA3 à partir d’ARN3. Nous avons démontré in vitro que l’accumulation de ncRNA3 est liée au blocage de Xrn1 par « coremin ». La protéine virale p14, un suppresseur du RNA silencing codée par l’ARN2, est aussi nécessaire au mouvement systémique du virus et interagit avec la séquence « coremin ». Nos travaux confirment que l’ARN3 est capable de complémenter partiellement un mutant allélique de p14 dans l’infection locale et systémique. Nos résultats mettent en évidence un effet de la protéine p14 sur la systémie du RNA silencing et sur une éventuelle cible cellulaire RDR6. The beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) is a multipartite positive-stranded RNA phytovirus. The RNA3 contains a « core » sequence in which resides the « coremin » motif of 20 nucleotides absolutely required for the viral systemic movement in Beta macrocarpa. The RNA3 undergoes a process that produces a noncoding RNA3 (ncRNA3), stabilized by « coremin » at its 5’ end. Using a yeast genetic approach, the exoribonuclease Xrn1 and plant XRN4 have been identified as being responsible for the ncRNA3 accumulation from RNA3 processing. In vitro, we showed that the ncRNA3 accumulation is due to the stalling of Xrn1 by “coremin”. The viral p14 protein, an RNA silencing suppressor encoded by the RNA2, is also required for the systemic movement and interacts with the “coremin” sequence. Our studies demonstrated the ability of RNA3 to partially complement an allelic p14 mutant in local and systemic infections. Our data highlighted an effect of the p14 protein on the RNA silencing movement and on the potential cellular target RDR6. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 9419051 Université de Strasbourg Strasbourg 2017-12-31 https://theses.hal.science/tel-01561088 application/pdf 13066754 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2016/Flobinus_Alyssa_2016_ED414.pdf http://www.theses.fr/2016STRAJ045/abes https://theses.hal.science/tel-01561088 https://theses.hal.science/tel-01561088 https://theses.hal.science/tel-01561088 Flobinus Alyssa 1989-12-23 FR 203065034 21212179 https://theses.fr/2016STRAJ045 2016STRAJ045 https://doi.org/10.70675/d5fad2f2zc6c5z4964za308z9f688d3c0e09 2016-09-16 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Gilmer David MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 089486021 Gagliardi Dominique MADS_PRESIDENT_DU_JURY 129248444 Gilmer David MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 089486021 Gagliardi Dominique MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 129248444 Saleh Maria-Carla MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 176597514 Bénard Lionel MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 170696057 Saleh Maria-Carla MADS_RAPPORTEUR_1 176597514 Bénard Lionel MADS_RAPPORTEUR_2 170696057 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 Gilmer David Gagliardi Dominique Gilmer David Gagliardi Dominique Saleh Maria-Carla Bénard Lionel Saleh Maria-Carla Bénard Lionel École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 9419051