Note ABES Caractérisation de protéines interagissant avec eIF4E, phosphorylées par TOR et modulant l’initiation de la traduction coiffe-dépendante chez Arabidopsis Characterization of eIF4E-binding proteins that are phosphorylated by TOR and function in cap-dependent translation initiation in Arabidopsis Voie de signalisation de TOR 4E-BP Initiation de la traduction coiffe-dépendante Arabidopsis ToRP TOR signalling pathway 4E-binding proteins 4E-BP Arabidopsis TOR Regulatory Proteins ToRP Translation initiation 572.8 581 Traduction génétique Arabidopsis thaliana Protéomique végétale Sérine / thréonine kinases Sérine-thréonine kinases TOR Dissertations universitaires Facteur-4E d'initiation eucaryote Dissertations universitaires Initiation de la traduction Dissertations universitaires Chez les mammifères l’initiation de la traduction et, plus particulièrement, la formation du complexe eIF4F, est principalement régulée par la protéine kinase TOR (Target of rapamycin). Cette voie de régulation fait intervenir les protéines 4E-BP (eIF4E-binding proteins) dont l’activité est modulée par la phosphorylation par TOR. Sous leur forme non-phosphorylée, les 4E-BP se lient au facteur d’initiation eIF4E, empêchent son recrutement dans le complexe eIF4F et inhibent ainsi l’initiation de la traduction. Phosphorylées par TOR, les 4E-BP perdent leur affinité pour eIF4E et sont remplacées par eIF4G ce qui active la traduction. La régulation de l’initiation de la traduction par TOR via 4E-BP a été bien décrite dans plusieurs modèles eucaryotes, tels que la levure, les insectes et les mammifères, mais reste encore obscure chez les plantes. Les recherches réalisées au cours de ma thèse ont permis l’identification de deux protéines homologues de 4E-BP chez Arabidopsis. Ces protéines, que nous avons appelées ToRP1 et ToRP2 (TOR Regulatory Proteins), sont caractérisées par la présence d’un motif consensus indispensable pour la liaison à eIF4E, et qui existe chez les protéines 4E-BP des mammifères ainsi que chez eIF4G et eIFiso4G d’Arabidopsis. La protéine ToRP1 est capable d’interagir spécifiquement avec eIF4E, mais aussi avec TOR via son extrémité N-terminale en système double-hybride de levure. ToRP1 et ToRP2 ont également été caractérisées comme étant des cibles directement phosphorylées par TOR chez Arabidopsis. Deux sérines, en position 49 et 89 dans la protéine ToRP1, ont été identifiées comme des sites potentiels de cette phosphorylation. De plus, l’état de phosphorylation de ces sites affecte l’interaction avec eIF4E en système double-hybride de levure. Par ailleurs, des plants d’Arabidopsis déficients en ToRP1 et ToRP2 renforcent la traduction strictement coiffe-dépendante de l’ARNm CYCB1;1, alors que la surexpression de ToRP1 ou de ToRP2 réprime sa traduction. Ces résultats suggèrent donc que les protéines ToRP, identifiées chez Arabidopsis, sont de nouvelles cibles directes de TOR, qui, par leur phosphorylation, régule l’initiation de la traduction coiffe-dépendante. The target of rapamycin (TOR) is an evolutionarily conserved kinase that is a critical sensor of nutritional and cellular energy and a major regulator of cell growth. TOR controls cap-dependent translation initiation, in particular the assembly of the eIF4F complex, by modulating the activity of eIF4E-binding proteins (4E-BPs). In their unphosphorylated state 4E-BP proteins sequester eIF4E and repress translation. Upon phosphorylation by TOR, 4E-BPs have a low affinity binding to eIF4E and are replaced by eIF4G thus activating translation initiation. 4E-BPs have been discovered in yeast and mammals but remain to be obscure in plants. Here, we identified and characterized two Arabidopsis proteins termed TOR Regulatory Proteins (ToRPs 1 and 2) that display some characteristics of mammalian 4E-BPs. ToRP1 and ToRP2 contain a canonical eIF4E-binding motif (4E-BM) found in mammalian 4E-BPs and Arabidopsis eIF4G and eIFiso4G. ToRP1 interacts with eIF4E, and, surprisingly, the N-terminal HEAT domain of TOR in the yeast two-hybrid system. ToRP1 and ToRP2 are highly phosphorylated at several phosphorylation sites in TOR-dependent manner in planta. Two of these phosphorylation sites have been identified as—S49 and S89—their phosphorylation status modulates ToRP1 binding to eIF4E in the yeast two-hybrid system. In plant protoplasts, ToRP2 can function as translation repressor of mRNAs that are strictly cap-dependent. Our results suggest that ToRPs can specifically bind the Arabidopsis cap-binding proteins (eIF4E/eIFiso4E) and regulate translation initiation under the control of TOR Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 9508006 Université de Strasbourg Strasbourg 2017-12-31 https://theses.hal.science/tel-03934519 application/pdf 10985990 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2016/SROUR_OLA_2016_ED414.pdf http://www.theses.fr/2016STRAJ091/abes https://theses.hal.science/tel-03934519 https://theses.hal.science/tel-03934519 https://theses.hal.science/tel-03934519 Srour Ola 1990-12-25 LB 204399394 40812573 https://theses.fr/2016STRAJ091 2016STRAJ091 https://doi.org/10.70675/37c1b2deze80dz444azac80z8cb770ce8dee 2016-12-07 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Ryabova Lyubov MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 133851710 Meyer Christian MADS_PRESIDENT_DU_JURY 067279120 Ryabova Lyubov MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 133851710 Meyer Christian MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 067279120 Gallois Jean-Luc MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 165284420 Martin Franck MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 189209038 Meyer Christian MADS_RAPPORTEUR_1 067279120 Gallois Jean-Luc MADS_RAPPORTEUR_2 165284420 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 ddc:580 Ryabova Lyubov Meyer Christian Ryabova Lyubov Meyer Christian Gallois Jean-Luc Martin Franck Meyer Christian Gallois Jean-Luc École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 9508006 confidentialité 2016-12-07 2022-12-31 confidentialité 2016-12-07 2022-12-31 confidentialité 2016-12-07 2022-12-31 confidentialité 2016-12-07 2022-12-31