Note ABES Understanding the mechanisms of histone modifications in vivo Comprendre les mécanismes de nouvelles modifications des histones in vivo Epigénétiques Histones Modifications post-traductionnelles Epigenetics Histones Post translational modifications 572.8 Histones Protéines -- Modifications posttraductionnelles Expression génique Chromatine Les modifications post-traductionnelles (MPTs) d’histones sont apparues comme un acteur majeur de la régulation de l’expression des gènes. Cependant peu de choses sont connues sur le réel impact des MPTs sur la chromatine. Il a été suggéré que les MPTs d’histones (H2A, H2B, H3 et H4) ont le potentiel de moduler la fonction chromatinienne selon un « codehistone » en recrutant des protéines spécifiques de liaison. L’objectif de mon projet est d’approfondir la fonction de l’acétylation du domaine globulaire de l’histone H3 et de comparer cette modification avec celles des queues N-terminale in vivo sur une lignée ES cellulaire. Pour étudier l’impact de ces MPTs in vivo, toutes les copies endogènes du gène H3 sauvage (WT) doivent être remplacées par des copies mutées. Ainsi la première étape de mon projet est d’établir une lignée cellulaire exprimant seulement H3 mutée (e.g reproduisant une acétylation permanente) afin d’étudier les effets des modifications sur le domaine globulaire de H3 sur (a) l’expression génique, (b) l’architecture chromatinienne mais également pour étudier (c) les effets réciproques et synergiques entre les différentes modifications du domaine globulaire et (d) comparer ces effets avec les modifications sur la queue N-terminale dans un système in vivo. Post-translational modifications (PTMs) of histones have emerged as key players in the regulation of gene expression. However, little is known to what extent PTMs can directly impact chromatin. It has been suggested that PTMs of core histones (H2A, H2B, H3 and H4) have the potential to govern chromatin function according to the so called ‘‘histone code’’ hypothesis by recruiting specific binding proteins. The goal of my project is to gain insight in the function acetylation within the globular domain of H3 and to compare these modifications with histone tail modifications, in vivo by using the CRISPR in mouse embryonic stem cells (ES). To study the impact of PTMs in vivo, all endogenous wild type (WT) H3 gene copies have to be replaced with mutant copies. Hence, the primary focus of my project is to establish cell lines that exclusively express mutated H3 (e.g. mimicking acetylation) in order to study effects of H3 globular domain modifications on (a) gene expression (b) chromatin architecture as well as to study (c) cross talks and synergisms between globular domain modifications and (d) compare the effects with tail modifications in an vivo system. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 3526563 Université de Strasbourg Strasbourg 2017-12-31 https://theses.hal.science/tel-02003415 application/pdf 6785527 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2016/Parameswaran-Kalaivani_Nithyha_2016_ED414.pdf http://www.theses.fr/2016STRAJ097/abes https://theses.hal.science/tel-02003415 https://theses.hal.science/tel-02003415 https://theses.hal.science/tel-02003415 Parameswaran Kalaivani Nithyha 1988-07-27 CA 204376904 21217906 https://theses.fr/2016STRAJ097 2016STRAJ097 https://doi.org/10.70675/f2af210dz8793z41a5z9c2eza555f78ea60b 2016-12-16 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Schneider Robert MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 190858001 Iovino Nicola MADS_PRESIDENT_DU_JURY 204377072 Schneider Robert MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 190858001 Iovino Nicola MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 204377072 Cammas Florence MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 138944814 Devys Didier MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 156396416 Iovino Nicola MADS_RAPPORTEUR_1 204377072 Cammas Florence MADS_RAPPORTEUR_2 138944814 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Schneider Robert Iovino Nicola Schneider Robert Iovino Nicola Cammas Florence Devys Didier Iovino Nicola Cammas Florence École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 3526563 confidentialité 2016-12-16 2018-12-31 confidentialité 2016-12-16 2018-12-31 confidentialité 2016-12-16 2018-12-31 confidentialité 2016-12-16 2018-12-31