Etude de la dynamique structurale du domaine de liaison au ligand de RXRα et implication de la phosphorylation dans la transcription
Langue Français
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Auteur : Eberhardt, Jérôme
Date de soutenance : 12-12-2016

Directeur(s) de thèse : Stote, Roland - Dejaegere, Annick

Président : Kellenberger, Esther
Rapporteur(s) : Etchebest, Catherine - Senet, Patrick
Membre(s) du jury : Stote, Roland - Dejaegere, Annick - Kellenberger, Esther - Etchebest, Catherine - Senet, Patrick - Labesse, Gilles

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Récepteur nucléaire, RXRα, Dynamique moléculaire, Phosphorylation, Carcinome hépatocellulaire, Réduction de la dimensionnalité
Mots-clés :
  • Complexes récepteur-ligand
  • Transcription génétique
  • Analyse conformationnelle
  • Phosphorylation
  • Rétinoïdes - Récepteurs
  • Récepteur des rétinoïdes X type alpha - Dissertations universitaires
Résumé : De nombreuses études révèlent que le domaine de liaison au ligand de RXRα est très dynamique, même en présence d'un ligand agoniste. Nous avons utilisé les données expérimentales (HDX, RMN et X-ray) disponibles sur ce domaine pour mettre en place un protocole, basé sur la dynamique moléculaire accélérée, permettant d'explorer efficacement la dynamique conformationnelle du domaine de liaison au ligand de RXRα et de valider les ensembles conformationnels obtenus. Ce protocole a été appliqué pour analyser l'influence de la phosphorylation pSer260, située à proximité de la surface d'interaction avec les protéines coactivatrice et impliquée dans le développement de carcinomes hépatocellulaires, sur la structure de ce domaine et sa dynamique. Parallèlement, une méthode de réduction de la dimensionnalité a été développé afin d'analyser de longues trajectoires de dynamique moléculaire. Ainsi grâce à cette méthode, nous avons pu identifier plusieurs nouvelles conformations alternative stables du domaine de liaison au ligand de RXRα.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2016STRAJ118
Type de ressource : Thèse