Note ABES Analysis of the chemical space of antimalarial compounds by generative topographie mapping Analyse de l'espace chimique des composés antipaludiques par la méthode GTM Espace chimique Visualisation GTM Paludisme Cartes universelles Chemical space Visualization GTM Malaria Universal maps 572.5 005.7 Antipaludiques Biomolécules actives QSAR (biochimie) Chimie -- Informatique Cartographie -- Informatique Cette thèse est consacrée à l’analyse de l’espace chimique des composés antipaludiques. L’analyse est faite à l’aide de la méthode des cartes topographiques génératrices (GTM). Un nouveau concept des cartes universelles est introduit et discuté en détail dans cette thèse : ce sont des cartes qui sont capables d’accommoder plusieurs jeux de données et les propriétés associées simultanément. Trois types des cartes sont construits et analysés : les cartes locales, globales et universelles. Elles sont toutes compétentes à la prédiction des composés actifs contre le parasite, ainsi qu’à l’analyse de l’espace chimique. Elles nous permettent d’étudier le recouvrement des données issues des sources différentes, de détecter des terra incognita de l’espace chimique, identifier des zones correspondantes aux différents mécanismes d’action, et révéler des incohérences d’annotations des données. This thesis is dedicated to the concept of the analysis of chemical space, and the application of thatconcept to antimalarial compounds. The analysis of the chemical space of antimalarial compoundshere is done with the aid of the Generative Topographic Mapping (GTM) method. A concept ofUniversal GTM maps is developed and discussed in detail in this thesis: these are maps that areable to accommodate different datasets and associated properties. Three types of maps are builtand analyzed: local, global, and universal. All these maps perform well in predicting compoundsactive against the parasite, as well as in the analysis of chemical space: they help us to study theoverlap of data coming from different sources, detect terra incognita of the antimalarial space,delineate zones corresponding to various mechanisms of action, as well as highlight theinconsistencies in data annotations. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 24879521 Université de Strasbourg Strasbourg 2018-12-31 https://theses.hal.science/tel-01758196 application/pdf 24544386 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2017/Sidorov_Pavel_2017_ED222.pdf http://www.theses.fr/2017STRAF050/abes https://theses.hal.science/tel-01758196 https://theses.hal.science/tel-01758196 https://theses.hal.science/tel-01758196 Sidorov Pavel 1989-11-01 RU 224215744 21211629 https://theses.fr/2017STRAF050 2017STRAF050 https://doi.org/10.70675/bc3c6c45z38f7z43b9zb1b6z82b1e1107978 2017-09-25 Chimie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Varnek Alexandre MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 124416993 Horvath Dragos MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 108942368 108942368 Kellenberger Esther MADS_PRESIDENT_DU_JURY 16406883X 16406883X Camproux Anne-Claude MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 129585041 129585041 Tetko Igor MADS_RAPPORTEUR_1 224216260 Morelli Xavier MADS_RAPPORTEUR_2 155010239 École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 CH 156504081 Chimie de la matière complexe (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 UMR 7140 157547027 403339 ddc:570 ddc:004 Varnek Alexandre Horvath Dragos Kellenberger Esther Camproux Anne-Claude Tetko Igor Morelli Xavier École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg) Chimie de la matière complexe (Strasbourg) PDF 24879521