Note ABES Coévolution dans le gène pol du VIH-1 : un carrefour aux frontières de nouvelles espèces du VIH Coevolution within HIV-1 pol gene : a crossroads at the borders of new HIV species VIH Intégrase Réseaux de coévolution Fonctionnalité HIV Integrase Coevolution networks Functionality 572.8 616.91 Intégrase du VIH Transcription génétique Coévolution Transcription inverse Dissertations universitaires L’intégrase (IN) est l’une des enzymes virales assurant la réplication du VIH. La fonctionnalité des protéines qui, comme celles du VIH, ont une variabilité de séquence repose sur des résidus non conservés, en plus des acides aminés conservés entre souches, qui ont un rôle important notamment lorsqu'ils font partie de réseaux de coévolution. Ces réseaux peuvent contrecarrer l'effet délétère d'une mutation par l'introduction de mutations compensatoires ailleurs dans la protéine. Ce travail a mis en évidence, par une étude comparative de différentes souches du VIH, des réseaux de coévolution étendus dans l'IN. Un résultat majeur est l'identification d'un nouveau motif assurant de multiples rôles dans le cycle infectieux. Le motif diffère entre les groupes M et O du VIH, mais est strictement conservé au sein de ces deux groupes en dépit d'une certaine flexibilité génétique en culture de cellules. Ceci suggère que ces groupes ont suivi des chemins évolutifs convergents bien que distincts. Integrase (IN) is one of the viral enzymes ensuring HIV replication. The functionality of proteins, which, like those from HIV, have sequence variability, relies on nonconserved residues, in addition to the conserved amino acids between strains, which have an important role especially when they are part of coevolution networks. These networks can counteract the deleterious effect of a mutation by introducing compensatory mutations elsewhere in the protein. This work has demonstrated, through a comparative study of different strains of HIV, extensive coevolution networks in IN. A major result is the identification of a new motif that provides multiple roles in the infectious cycle. The pattern differs between HIV groups M and O, but is strictly conserved within these two groups despite some genetic flexibility in cell culture. This suggests that these groups followed convergent, although distinct, evolution pathways. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 12346527 Université de Strasbourg Strasbourg 2018-12-31 https://theses.hal.science/tel-01744713 application/pdf 20072968 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2017/KANJA_Marine_2017_ED414.pdf http://www.theses.fr/2017STRAJ077/abes https://theses.hal.science/tel-01744713 https://theses.hal.science/tel-01744713 https://theses.hal.science/tel-01744713 https://theses.hal.science/tel-01744713 Kanja Marine 1991-09-06 FR 225402114 20906119 https://theses.fr/2017STRAJ077 2017STRAJ077 https://doi.org/10.70675/7add66cczbb9ez4099z83c1zf797f8fcba3a 2017-09-28 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Negroni Matteo MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 136869025 Gouet Patrice MADS_PRESIDENT_DU_JURY 128912758 Dimitrova Maria MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 204203112 Gouet Patrice MADS_RAPPORTEUR_1 128912758 Lavigne Marc MADS_RAPPORTEUR_2 145102033 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 ddc:610 Negroni Matteo Gouet Patrice Dimitrova Maria Gouet Patrice Lavigne Marc École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg) PDF 12346527