Note ABES Structural study of mRNA translation in kinetoplastids by Cryo-electron microscopy Etude structurale de la traduction de ARNm chez les kinétoplastides par cryomicroscopie électronique Kinétoplastides Traduction Ribosome Cryo-ME Kinetoplastids Translation Ribosome Cryo-EM 572.8 Cryomicroscopie Traduction génétique ARN ribosomique Dissertations universitaires Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires, et qui menace plus de 400 millions de personnes dans le monde entier. Ils possèdent des segments d'expansion d'ARNr (SE) inhabituellement plus larges dans les sous-unités 40S. Ici, nous avons purifié à partir de lysats de cellules de T. cruzi des complexes d'initiation natifs (48S IC) et des sous-unités de 40S natives que nous avons ensuite analysées par cryo-ME. La structure des 48S IC révèle certains des aspects spécifiques de la traduction aux kinétoplastides, tels qu'un réseau d’interaction complexe entre eIF3 et SEs. En outre, notre structure met en évidence le rôle de DDX60 dans l'initiation de la traduction chez les kinétoplastides. La structure d'une sous-unité 40S native révèle l'existence d'un facteur non caractérisé (appelé ηF). Le site de liaison de ηF suggère un rôle dans le contrôle de la traduction. De plus, nous avons rapporté́ la structure d’une nouvelle protéine ribosomale (-r) spécifique des kinétoplastides (KSRP). Notre travail pose les premières bases structurales des aspects spécifiques de l'initiation de la traduction chez les kinétoplastides. Kinetoplastid is a group of flagellated protozoans, which threatens more than 400 million people world-wide. They possess unusual large rRNA expansion segments (ES) in the 40S, such as ES6S, ES7S and ES9S and their location suggests an involvement in the initiation process. Furthermore, all mature mRNAs possess a conserved 5’ spliced-leader. Here, we purified from T. cruzi cell lysates native initiation complexes and native 40S subunits that we then analysed by cryo-EM. The structure of native initiation complexes reveals several kinetoplastid-specific aspects of translation, such as an intricate interaction network between eIF3 and ES6S and ES7S. Furthermore, it reveals the role of DDX60 in translation initiation in kinetoplastids. The structure of native 40S subunits reveals the existence of an uncharacterized factor (termed ηF) bound at platform of the 40S. The binding site of ηF suggests a role in translational control. Moreover, we reported a novel kinetoplastid-specific ribosomal (r-) protein (KSRP) bound to the 40S subunit. Our work represents the first structural characterization of kinetoplastids-specific aspects of translation initiation. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 21144015 Université de Strasbourg Strasbourg 2018-12-31 https://theses.hal.science/tel-02918027 application/pdf 33887898 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2017/BRITO-QUERIDO_Jailson_2017_ED414.pdf http://www.theses.fr/2017STRAJ108/abes https://theses.hal.science/tel-02918027 https://theses.hal.science/tel-02918027 https://theses.hal.science/tel-02918027 https://theses.hal.science/tel-02918027 Brito Querido Jailson Fernando 1984-06-29 PT 227351339 21421623 https://theses.fr/2017STRAJ108 2017STRAJ108 https://doi.org/10.70675/f6e15ceaz851bz4e34zb261z900ff32f1532 2017-12-11 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Hashem Yaser MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 170577945 Bastin Philippe MADS_PRESIDENT_DU_JURY 085224154 Bastin Philippe MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 085224154 Frugier Magali MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 160427703 Westhof Eric MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 071323813 Clayton Christine MADS_RAPPORTEUR_1 227351665 Innis Axel MADS_RAPPORTEUR_2 203094832 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 VS 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 Hashem Yaser Bastin Philippe Bastin Philippe Frugier Magali Westhof Eric Clayton Christine Innis Axel École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg) PDF 21144015 confidentialité 2017-12-11 2019-12-11 confidentialité 2017-12-11 2019-12-11 confidentialité 2017-12-11 2019-12-11 confidentialité 2017-12-11 2019-12-11