Note ABES RNA/RNA interactions involved in the regulation of Benyviridae viral cicle Interactions ARN/ARN impliquées dans la régulation du cycle viral des Benyviridae Phytovirus Génome ségmenté Intégrité génomique Formule virale Mouvement viral à longue distance Interaction ARN/ARN Phytovirus Segmented genome Genome integrity Genome formula Systemic movement RNA/RNA interaction 572.8 579.2 Phytovirus Maladies -- Aspect moléculaire Betterave à sucre Viroses ARN -- Réplication ARN viral Interférence par ARN Dissertations universitaires Pour préserver l’intégrité de leur génome, les virus multipartite à ARN nécessitent une forte multiplicité d’infection qui représente un coût biologique inapproprié en terme de réplication virale. Dans cette étude, un réseau d’interaction entre ARN génomiques (ARNg), constitué d’au moins un type de chaque ARNg est proposé. Un tel réseau permet de réduire les coûts biologiques liés à la réplication en assurant une reconnaissance intermoléculaire et une mobilisation d’un complexe RNP modulaire maintenant l’intégrité du génome. Un tel complexe est considéré comme l’unité infectieuse mobile assurant la dissémination du virus dans la plante entière. Le but de cette thèse a été de démontrer l’existence d’interactions entre les ARNg du beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) et de déterminer l’incidence de ces interactions sur le cycle viral. Une formule génomique a été déterminée pour différentes plantes et tissus. Les ARNg ont tous été co-détectés dans des cellules isolées issues de tissus infectés. Un domaine d’interaction entre l’ARN1 et 2 a été identifié in vitro et in silico puis évaluée in vivo par des approches de mutagenèse et de complémentation. Multipartite RNA virus condition to provide a complete set of genomic segments in each infected cell implies a high level of MOI that results in an unsustainable biological cost in terms of viral replication. In the proposed model, to minimize the cost of the genome integrity preservation, a network of RNA/RNA interactions determines the recognition and the mobilization of at least one of each genomic RNAs in a modular RNP complex. Such complex must be considered as the mobile infectious unit of the segmented genome during viral spread in the plant. The Aim of this thesis was to experimentally determine the existence of RNA/RNA interactions between BNYVV RNAs and their implication in the viral cycle. BNYVV genomic segments have been co-detected within isolated single cells from systemic tissues where they accumulate to reach set point genome formulas. In the model where vRNAs interact each other to form the minimal mobile infective unit, RNA1 and RNA2 interaction domain has been identified in silico and in vitro. The rationale of such an interaction has been provided in vivo using BNYVV and Beet soil-borne mosaic virus chimeras. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 5215408 Université de Strasbourg Strasbourg 2018-12-31 https://theses.hal.science/tel-02003448 application/pdf 5119319 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2018/DALLARA_Mattia_2018_ED414.pdf http://www.theses.fr/2018STRAJ019/abes https://theses.hal.science/tel-02003448 https://theses.hal.science/tel-02003448 https://theses.hal.science/tel-02003448 Dall'Ara Mattia 1984-08-24 IT 229647677 https://theses.fr/2018STRAJ019 2018STRAJ019 https://doi.org/10.70675/dcc9193fz5e27z499fzb131zabc1e4bdd544 2018-05-18 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Università degli studi (Bologne, Italie) MADS_ETABLISSEMENT_DE_COTUTELLE_1 026430479 Doctorat Docteur es non oui Ratti Claudio MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 229648053 Gilmer David MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 089486021 Marquet Roland MADS_PRESIDENT_DU_JURY 060810319 Iotti Mirco MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 229648495 Blanc Stéphane MADS_RAPPORTEUR_1 224068687 Brandimarti Renato MADS_RAPPORTEUR_2 229648193 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 Università degli studi (Bologne, Italie) Ratti Claudio Gilmer David Marquet Roland Iotti Mirco Blanc Stéphane Brandimarti Renato École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 5215408 confidentialité 2018-05-18 2018-12-31 confidentialité 2018-05-18 2018-12-31 confidentialité 2018-05-18 2018-12-31 confidentialité 2018-05-18 2018-12-31