Note ABES Application des nouvelles approches de cristallisation et de cristallographie sérielle à l’étude structurale de complexes enzymes : ARNt Application of new crystallization approaches and serial crystallography to the structural study of enzyme/tRNA complexes Biologie structurale Cristallographie sérielle Cristallogénèse Puces microfluidiques Xtal Controller Organisme psychrophile Organisme pathogène Structural biology Serial crystallography Crystallogenesis Microfluidic chips Xtal Controller Psychrophilic organism Pathogenic organism 571.4 572.5 548 Complexes multienzymatiques Structure Bioinformatique structurale Cristallographie Microfluidique Cette thèse porte sur deux aspects complémentaires, le développement et l’implémentation de nouvelles approches de cristallisation et de cristallographie sérielle ainsi que leur mise en œuvre dans l’étude structurale de complexes enzymes : ARNt. La cristallographie est la méthode la plus employée en biologie structurale, mais elle présente encore des points délicats. Plusieurs méthodes avancées ont été déployées dans ce travail pour y pallier qui ont conduit à la résolution de la structure de l’ARNt nucléotidyltransférase du psychrophile Planococcus halocryophilus et à l’étude de son adaptation structurale au froid ; des puces microfluidiques de cristallisation qui ont servi à la résolution de plusieurs structures à température ambiante par cristallographie sérielle ; enfin le Xtal Controller utilisé pour l’étude d’évènements de nucléation et de croissance cristalline dans un but de préparation d’échantillons pour analyse sous rayonnement XFEL. Entre autres systèmes biologiques, cette thèse présente la caractérisation de deux familles d’inhibiteurs visant les aspartyl-ARNt synthétases, notamment du pathogène Pseudomonas aeruginosa. This thesis focuses on two complementary aspects, the development and implementation of new approaches of crystallization and of serial crystallography as well as their use in the structural study of enzymes/tRNA complexes. Crystallography is the most used method in structural biology, but it presents delicate points. Different methods were implemented in this work to overcome these points, which led to the resolution of the structure of the CCA-adding enzyme of the psychrophilic organism Planococcus halocryophilus and to the study of its structural adaptation to the cold; novel microfluidic crystallization chips that have been used for the resolution of several structures by serial crystallography at room-temperature; finally the Xtal Controller used for the study of nucleation and crystal growth events with the purpose of preparing samples for analysis under XFEL radiation. Among other biological systems, this thesis presents the study and characterization of two families of inhibitors targeting aspartyl-tRNA synthetases, including the one of the pathogenic organism Pseudomonas aeruginosa. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 64844357 Université de Strasbourg Strasbourg 2019-12-31 https://theses.hal.science/tel-02301381 application/pdf 89936356 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2018/de-wijn_raphael_2018_ed414.pdf http://www.theses.fr/2018STRAJ095/abes https://theses.hal.science/tel-02301381 https://theses.hal.science/tel-02301381 https://theses.hal.science/tel-02301381 https://theses.hal.science/tel-02301381 De Wijn Raphaël 1992-01-25 FR 238295745 https://theses.fr/2018STRAJ095 2018STRAJ095 https://doi.org/10.70675/353d79d1z8640z4406za5ecze31fb15a1ec5 2018-12-14 Biophysique et biologie structurale Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Sauter Claude MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 142349844 Renaud Jean-Paul MADS_PRESIDENT_DU_JURY 031538614 Czjzek Mirjam MADS_RAPPORTEUR_1 145158225 Schmitt Emmanuelle MADS_RAPPORTEUR_2 164047573 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 ddc:540 Sauter Claude Renaud Jean-Paul Czjzek Mirjam Schmitt Emmanuelle École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg) PDF 64844357