Note ABES Rôle complexe de l’uridylation dans le métabolisme des ARNm chez Arabidopsis thaliana The complex role of uridylation in the metabolism of mRNA in Arabidopsis thaliana Uridylation Arabidopsis thaliana Dégradation des ARNm Déadénylation Uridylation MRNA decay Deadenylation Arabidopsis thaliana 572.4 572.8 Biologie moléculaire végétale ARN messagers Métabolisme -- Génétique Séquençage à haut débit Arabidopsis thaliana La dégradation des ARNm participe à la régulation de l’expression des gènes, régulation essentielle au développement et à la survie des organismes. L’uridylation des ARNm favorise leur dégradation et est un processus conservé chez la plupart des eucaryotes. Mes travaux de thèse ont porté sur la caractérisation de URT1, une TUTase responsable de l’uridylation des ARNm chez Arabidopsis. J’ai notamment établi une chaine d’interactions entre URT1 et des facteurs impliqués dans l’inhibition de la traduction. Ces interactions sont probablement conservées dans l’ensemble des plantes terrestres. De plus, je montre grâce à une méthode d’analyse par séquençage à haut-débit des extrémités 3’ d’ARNm candidats que le niveau d’expression de URT1 ou de différentes versions mutées ou tronquées peut contrôler les profils de distributions de taille des queues poly(A) uridylées et non-uridylées. De manière très intéressante, la modification de ces profils de distributions est associée à la répression de l’expression d’un gène rapporteur, sans modification de l’accumulation des ARNm correspondants. Mes résultats contribuent à une meilleure compréhension des rôles moléculaires de l’uridylation des ARNm chez Arabidopsis et ouvrent des perspectives nouvelles quant à la diversité des rôles de l’uridylation dans le métabolisme des ARNm. RNA degradation is an essential step of gene regulation and is critical for development and survival of organisms. Uridylation of mRNAs triggers their degradation and is conserved in most eukaryotes. My PhD thesis is focused on the characterization of URT1, a TUTase responsible for the uridylation of mRNAs in Arabidopsis. I have identified a chain of interactions linking URT1 to factors involved in translation inhibition. Those interactions are likely conserved in all land plants. In addition, I show by 3’ RACE-seq, a method using high throughput sequencing to characterize the 3’ extremities of candidate mRNAs, that URT1 expression levels can control the distribution profiles of uridylated and non-uridylated poly(A) tails. Interestingly, the modification of these distribution profiles is associated to the repression of the expression of a reporter gene, without affecting mRNA steady-state levels. My results contribute to a better understanding of the molecular roles of mRNA uridylation in Arabidopsis and open new perspectives related to the diversity of the roles of uridylation in the metabolism of mRNAs. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 9887085 Université de Strasbourg Strasbourg 2020-12-31 https://theses.hal.science/tel-02493354 application/pdf 23308231 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2018/scheer_helene_2018_ED414.pdf http://www.theses.fr/2018STRAJ114/abes https://theses.hal.science/tel-02493354 https://theses.hal.science/tel-02493354 https://theses.hal.science/tel-02493354 Scheer Hélène 1989-07-15 FR 238698106 https://theses.fr/2018STRAJ114 2018STRAJ114 https://doi.org/10.70675/7d749f23z6506z415bz8096z86d2665e256a 2018-09-28 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Gagliardi Dominique MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 129248444 Pfeffer Sébastien MADS_PRESIDENT_DU_JURY 069221928 Gagliardi Dominique MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 129248444 Pfeffer Sébastien MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 069221928 Weil Dominique MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 155155059 Deragon Jean-Marc MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 139510281 Weil Dominique MADS_RAPPORTEUR_1 155155059 Deragon Jean-Marc MADS_RAPPORTEUR_2 139510281 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 Gagliardi Dominique Pfeffer Sébastien Gagliardi Dominique Pfeffer Sébastien Weil Dominique Deragon Jean-Marc Weil Dominique Deragon Jean-Marc École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 9887085