Développements en protéomique pour mieux comprendre la physiologie de l’ours brun hibernant et ouvrir la voie vers de nouvelles thérapies contre l’atrophie musculaire humaine
Proteomics developments to better understand hibernating bear physiology and pave the way toward new therapeutic solutions against human muscle atrophy
Protéomique quantitative
Spectrométrie de masse
Ours brun
Hibernation
Développements bioinformatiques
Quantitative proteomics
Mass spectrometry
Brown bear
Hibernation
Bioinformatic developments
543
572.8
Ours brun
Génétique moléculaire
Protéomique
Amyotrophie
Thérapeutique
Hibernation
Appliquer les stratégies d’analyse protéomique à des échantillons d’organismes « exotiques » requiert des développements, que nous avons réalisés pour étudier les mécanismes d’épargne protéique chez l’ours brun hibernant. La complémentarité des approches protéomiques (SDS PaGE-XIC, 2D-DIGE-MS, LC-SRM-MS) et des développements bioinformatiques (e.g. utilisation de données d’assemblage du génome, extraction d’annotations fonctionnelles [Gene Ontology, neXtProt, KEGG]) ont montré que la beta-oxydation est préférentielle dans le muscle, la glycolyse étant maintenue. Les niveaux élevés en acides gras omega 3, le stress oxydant diminué, et l’existence de composés anti-protéolytiques dans le sérum des ours hibernants contribuent à l’épargne des muscles. Pour identifier ces composés, nous avons développé le fractionnement du sérum d’ours (chromatographie, protéolyse, déplétion des protéines majoritaires) et montré que les corps cétoniques pourraient être impliqués. Ces résultats suggèrent de nouvelles solutions thérapeutiques contre l’atrophie musculaire des personnes immobilisées, âgées ou encore des astronautes.
To analyze samples from "exotic" organisms using proteomics, analytical developments are required. Our developments were made to study protein saving mechanisms in hibernating brown bears. The complementarity of proteomics approaches (SDS PaGE-XIC, 2D-DIGE-MS, LC-SRM-MS) and bioinformatics developments (e.g. use of genome assembly data, extraction of functional annotations [Gene Ontology, neXtProt, KEGG]) have led to show that muscle beta-oxidation is preferential, glycolysis being maintained. High levels of omega 3 fatty acids, decreased oxidative stress, and the existence of anti-proteolytic compounds in the serum of hibernating bears contribute to muscle sparing. To identify these compounds, we developed fractionation of the bear serum (chromatography, proteolysis, high abundance protein depletion) and showed that ketone bodies could be involved. These results suggest new therapeutic solutions against muscle atrophy in immobilized people, the elderly or astronauts.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
fr
PDF
39778108
Université de Strasbourg
Strasbourg
2020-12-31
https://theses.hal.science/tel-02991593
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39522139
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2019/Chazarin_Blandine_2019_ED222.pdf
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https://theses.hal.science/tel-02991593
https://theses.hal.science/tel-02991593
https://theses.hal.science/tel-02991593
https://theses.hal.science/tel-02991593
Chazarin
Blandine
1991-03-18
FR
250188392
https://theses.fr/2019STRAF037
2019STRAF037
https://doi.org/10.70675/7dcc2a56z9fc3z48cfz9080zbad6ebabfc56
2019-10-15
Chimie analytique
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Bertile
Fabrice
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076890562
Fournier
Isabelle
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Bertile
Fabrice
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Fournier
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Pineau
Charles
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Bergouignan
Audrey
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Fournier
Isabelle
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Pineau
Charles
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École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
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Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
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Bertile
Fabrice
Fournier
Isabelle
Bertile
Fabrice
Fournier
Isabelle
Pineau
Charles
Bergouignan
Audrey
Fournier
Isabelle
Pineau
Charles
École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg)
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