Thermodynamic study of protein synthesis and of antibiotics targeting the ribosome
Etude thermodynamique de la synthèse protéique et d’antibiotiques ciblant le ribosome
Ribosome
Thermodynamique
Cinétique
Antibiotique
Macrolides
IRES intergénique
Ribosome
Thermodynamics
Kinetics
Antibiotics
Macrolides
Intergenic IRES
572.8
571.4
579.3
Site d'entrée interne des ribosomes
Synthèse protéique
Traduction génétique
Résistance aux antibiotiques
Protéines ribosomiques
Le ribosome est une machine biomoléculaire primordiale pour la survie de tout organisme du fait de son rôle central au sein de la synthèse protéique. La caractérisation des interactions avec ses nombreux partenaires est un élément crucial pour mieux comprendre les mécanismes de la traduction et de son inhibition chez les eucaryotes et procaryotes. Cette inhibition est d’ailleurs une stratégie utilisée par beaucoup d’antibiotiques ciblant le ribosome pour lutter contre les infections bactériennes. La compréhension de leur mode d’action est devenue une priorité mondiale pour faire face au problème de la résistance bactérienne. Chez les eucaryotes, une autre stratégie est employée par les virus pour bloquer et s’approprier la machinerie traductionnelle de l’hôte grâce à des structures d’ARN non codant (IRES) capables de recruter directement le ribosome. Bien que largement caractérisés, peu de données thermodynamiques et cinétiques sont disponibles concernant ces deux systèmes d’interaction avec le ribosome. Mon projet a pour vocation d’utiliser des approches biophysiques innovantes afin de compléter les études sur les interactions du ribosome d’E. coli avec les macrolides, et du ribosome de S. cerevisiae avec l’IRES intergénique du CrPV.
The ribosome is a biomolecular machine essential for the survival of any organism due to its central role in protein synthesis. The characterization of its interactions with its many partners is a crucial element in better understanding the mechanisms of translation and inhibition in eukaryotes and prokaryotes. Inhibition of translation is a strategy used by many ribosome-targeting antibiotics to fight bacterial infections. Understanding their mode of action has become a global priority in addressing the problem of bacterial resistance. In eukaryotes, another strategy is used by viruses to block and appropriate the host's translational machinery through non-coding RNA structures (IRES) capable of directly recruiting the ribosome. Although widely characterized, few thermodynamic and kinetic data are available for these two ribosome interaction systems. My project is intended to use innovative biophysical approaches in order to provide an original view of the interactions of the E. coli ribosome with macrolides, and of the S. cerevisiae ribosome with the intergenic IRES of the CrPV.
Electronic Thesis or Dissertation
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8063102
Université de Strasbourg
Strasbourg
2019-12-31
https://theses.hal.science/tel-02415458
application/pdf
7944058
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2019/schenckbecher_emma_2019_ED414.pdf
http://www.theses.fr/2019STRAJ035/abes
https://theses.hal.science/tel-02415458
https://theses.hal.science/tel-02415458
https://theses.hal.science/tel-02415458
https://theses.hal.science/tel-02415458
Schenckbecher
Emma
1992-03-25
FR
241514185
https://theses.fr/2019STRAJ035
2019STRAJ035
https://doi.org/10.70675/5f6f8c55z65e1z418cz887az5ff07b706a44
2019-09-20
Biophysique et biologie structurale
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Ennifar
Éric
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1
060834978
Innis
Axel
MADS_PRESIDENT_DU_JURY
203094832
Ennifar
Éric
MADS_MEMBRE_DU_JURY_1
060834978
Innis
Axel
MADS_MEMBRE_DU_JURY_2
203094832
Gillet
Reynald
MADS_MEMBRE_DU_JURY_3
093627211
Yusupova
Gulnara
MADS_MEMBRE_DU_JURY_4
172402255
Munoz
Eva
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241514339
Innis
Axel
MADS_RAPPORTEUR_1
203094832
Gillet
Reynald
MADS_RAPPORTEUR_2
093627211
École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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Fédération de recherche de l’Institut de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
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157772845
496829
Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
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ddc:570
Ennifar
Eric
Innis
Axel
Ennifar
Eric
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Gillet
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Yusupova
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École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Fédération de recherche de l’Institut de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg)
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