Note ABES Détection des ARNs viraux par Dicer-2 chez la drosophile Sensing of viral RNAs by Dicer-2 in drosophila Dicer-2 D. melanogaster Dicistrovirus Séquençage à haut débit Dicer-2 D. melanogaster Dicistrovirus High-throughput sequencing 572.8 579.2 ARN viral Séquençage nucléotidique à haut débit ARN interférence Drosophila melanogaster Interférence par ARN Ribonuclease III Je me suis intéressé au système de défense anti-viral majeur de Drosophila melanogaster qui est la voie du RNA silencing (siRNA). A ce jour, le seul senseur d’acide nucléique viral et activateur de la voie siRNA est Dicer-2. Ainsi, le travail que j’ai effectué́ a permis d’apporter de nouvelles informations concernant la détection des ARNs viraux par Dicer-2. L’utilisation de méthodes de séquençage à haut débit (HTS) des petits ARNs dans des cellules S2 infectées par le Drosophila C Virus (DCV) à des temps précoces m’a permis de proposer un point d’entrée précis et interne de Dicer-2 sur l’ARN double brin de ce dicistrovirus. La validation de ce point faible dans la défense du virus a été effectuée en réalisant un HTS des petits ARNs dans des mouches de différents génotypes infectées avec DCV. J’ai ensuite caractérisé plus en profondeur cette région du génome virale en déterminant tout d’abord sa structure 2D puis sa sensibilité à des clivages médiés par des extraits embryonnaires de mouches. Finalement, l’utilisation de différents variants de Dicer-2 présentant des mutations du domaine DRA m’a permis de proposer un nouveau mécanisme de fonctionnement de cette protéine. My Ph.D revolved around the study of the major antiviral defense system of Drosophila melanogaster: the siRNA pathway. To date, the only viral nucleic acid sensor and siRNA pathway activator in drosophila is Dicer-2. Thus, the work I have done has provided new information regarding the detection of viral RNAs by Dicer-2. The use of high throughput sequencing (HTS) methods of small RNAs in S2 cells infected with Drosophila C Virus (DCV) at early time points has allowed me to propose a precise and internal entry point for Dicer-2 on the double-stranded RNA of this dicistrovirus. The validation of this weak point in the defence of the virus was carried out by performing an HTS of small RNAs in flies of different genotypes infected with DCV. I then characterized this region of the viral genome in more depth by first determining its 2D structure and then its sensitivity to cleavages mediated by embryonic fly extracts. Finally, the use of different variants of Dicer-2 with mutations in the DRA domain allowed me to propose a new mechanism of action for this protein. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 69135456 Université de Strasbourg Strasbourg 2019-12-31 https://theses.hal.science/tel-03920254 application/pdf 84928275 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2019/TALIDE_Loic_2019_ED414.pdf http://www.theses.fr/2019STRAJ036/abes https://theses.hal.science/tel-03920254 https://theses.hal.science/tel-03920254 https://theses.hal.science/tel-03920254 Talide Loic 1993-02-19 FR 241515254 https://theses.fr/2019STRAJ036 2019STRAJ036 https://doi.org/10.70675/5c0171d7z3104z4ec8zb99cz56e13c131070 2019-10-22 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Meignin Carine MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 238184706 Pichlmair Andreas MADS_PRESIDENT_DU_JURY 241515416 Meignin Carine MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 238184706 Pichlmair Andreas MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 241515416 Simonelig Martine MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 074621920 Blevins Todd MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 236110039 Sarkies Peter MADS_MEMBRE_DU_JURY_5 241515629 Pichlmair Andreas MADS_RAPPORTEUR_1 241515416 Simonelig Martine MADS_RAPPORTEUR_2 074621920 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157771342 561325 ddc:570 Meignin Carine Pichlmair Andreas Meignin Carine Pichlmair Andreas Simonelig Martine Blevins Todd Sarkies Peter Pichlmair Andreas Simonelig Martine École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg) PDF 69135456 confidentialité 2019-10-22 2022-12-31 confidentialité 2019-10-22 2022-12-31 confidentialité 2019-10-22 2022-12-31 confidentialité 2019-10-22 2022-12-31