Intégration de l'évolution pour contribuer à l'étude de la relation séquence, structure, fonction des protéines
Langue Français
Accéder au document

Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.

 
Auteur : Bianchetti, Laurent
Date de soutenance : 02-10-2019

Directeur(s) de thèse : Poch, Olivier - Dejaegere, Annick

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Bioinformatique et biologie des systèmes
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : Evolution, Dynamique moléculaire, Dimérisation, Récepteurs nucléaires, Sectm1, Tex19, Phylogénèse moléculaire, Protéine, Fonction, Structure, Séquence
Mots-clés :
  • Protéomique
  • Immunothérapie anticancéreuse
  • Dimérisation
  • Dynamique moléculaire
Résumé : Intégrer l’évolution peut aider à comprendre la relation séquence, structure, fonction des protéines. Dans un 1er projet, j’ai utilisé la phylogénèse moléculaire pour montrer que les gènes Testis expressed 19 » (Tex19) et « Secreted and transmembrane 1 » (Sectm1) coévoluent. Bien que Tex19 et Sectm1 interviennent dans des processus biologiques différents, régulation des transposons et immunité respectivement, la coévolution établit entre eux un lien fonctionnel très fort. Comme Tex19 ne s’exprime que dans le testicule de l’adulte sain et en cellule cancéreuse, ce résultat pourrait présenter un intérêt en immunothérapie du cancer. Dans un 2nd projet, je me suis appuyé sur des calculs de modélisation moléculaire et sur l’analyse d'évolution de séquence pour interroger la validité de la structure de l’homodimère du domaine de liaison au ligand (LBD) du récepteur ɑ aux glucocorticoïdes (GR ɑ) [Bledsoe R.K. et al, 2002]. Premièrement, ce complexe serait vraisemblablement un artefact de contact cristallin. Deuxièmement, j’ai identifié un assemblage alternatif présentant les caractéristiques moléculaires d’une interface de contact biologique.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2019STRAJ060
Type de ressource : Thèse