Note ABES Méthylation de l'ADN : fonctions et ciblage au cours du développement chez la souris DNA methylation : functions and recruitment during mouse development. Épigénitique Développement DNMT Méthylation de l’ADN Epigenetics Development DNMT DNA methylation 572.8 Embryologie expérimentale Méthylome Épigénétique Souris de laboratoire La méthylation des cytosines est une modification épigénétique catalysée par la famille des ADN méthyltransférases (DNMTs). C’est une marque répressive lorsqu’elle est adressée sur les îlots CpG des promoteurs de gènes. Le développement embryonnaire murin est caractérisé par une reprogrammation de la méthylation de l’ADN qui est critique pour le développement de l’embryon. Cependant, la contribution des différentes DNMTs dans la méthylation du génome ainsi que les mécanismes qui ciblent la méthylation de l'ADN vers certains gènes durant le développement embryonnaires sont mal connus. En combinant des approches de cartographie génomique avec des lignées génétiquement modifiées de souris, mes travaux de Thèse ont permis de clarifier la contribution des différentes DNMTs dans la méthylation du génome dans l’embryon : DNMT3A et DNMT3B sont strictement impliqués dans la méthylation de novo, et DNMT1 est strictement impliqué dans son maintien au cours des divisions cellulaires. De plus, l’analyse d’embryons globalement déméthylés a révélé de nombreuses fonctions de la méthylation de l’ADN dans le maintien de l'intégrité transcriptomique de l'embryon en réprimant des gènes gamétiques, des gènes du développement, des promoteurs cryptiques ainsi qu’un large panel de transposons. Dans un deuxième temps, j’ai étudié le rôle du facteur de transcription E2F6 dans le ciblage de la méthylation de l'ADN in vivo chez la souris. Mes résultats démontrent que E2F6 facilite l’acquisition de la méthylation de l’ADN au niveau du promoteurs des gènes gamétiques et est nécessaire pour initier leur répression à long terme au cours de l'embryogenèse. Dans leur ensemble, ces travaux contribuent à mieux comprendre les fonctions et mécanismes de ciblage de la méthylation de l'ADN au cours de l'embryogenèse des mammifères. Cytosine methylation is an epigenetic modification catalyzed by the family of DNA methyltransferases (DNMTs). This modification is involved in gene repression when it is addressed to CpG islands in gene promoters. Global DNA methylation reprogramming occurs in mice during the early phases of embryogenesis, which is critical for proper embryo development. However, the contribution of different DNMTs in genome methylation and the mechanisms that target DNA methylation to specific genes during embryonic development are poorly understood. By combining genomic mapping with genetically modified mouse lines, my Thesis work clarified the contribution of the different DNMTs in genome methylation in the embryo: DNMT3A and DNMT3B are strictly involved in de novo methylation, and DNMT1 is strictly involved in the maintenance of DNA methylation during cellular divisions. In addition, the analysis of globally demethylated embryos revealed numerous functions of DNA methylation in maintaining the transcriptomic intergrity of the embryo by repressing germline genes, developmental genes, cryptic promoters as well as a large panel of transposons.
 In the second part of my Thesis, I studied the role of the E2F6 transcription factor in the targeting of DNA methylation in vivo in mice. My results demonstrate that E2F6 facilitates the acquisition of DNA methylation in the promoters of germline genes and is required to initiate their long-term epigenetic silencing during embryogenesis. Collectively, this work contributes to a better understanding of the functions and targeting mechanisms of DNA methylation during mammalian embryogenesis. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 10882105 Université de Strasbourg Strasbourg 2020-12-31 https://theses.hal.science/tel-03510184 application/pdf 15584704 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2019/DAHLET_Thomas_2019_ED414.pdf https://theses.fr/2019STRAJ075/abes https://theses.hal.science/tel-03510184 https://theses.hal.science/tel-03510184 Dahlet Thomas 1991-07-19 FR 248201638 https://theses.fr/2019STRAJ075 2019STRAJ075 https://doi.org/10.70675/9ac7845czeb7dz4b51z9102zfa7c1da173ca 2019-09-30 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Weber Michaël MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 078857430 Bourc'his Déborah MADS_PRESIDENT_DU_JURY 152345876 Weber Michaël MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 078857430 Bourc'his Déborah MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 152345876 Déjardin Jérôme MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 084444010 Tora Laszlo MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 069776113 Bourc'his Déborah MADS_RAPPORTEUR_1 152345876 Déjardin Jérôme MADS_RAPPORTEUR_2 084444010 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Biotechnologie et signalisation cellulaire (Strasbourg ; 2011-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157715205 207563 ddc:570 Weber Michaël Bourc'his Déborah Weber Michaël Bourc'his Déborah Déjardin Jérôme Tora Laszlo Bourc'his Déborah Déjardin Jérôme École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Biotechnologie et signalisation cellulaire (Strasbourg ; 2011-....) PDF 10882105 confidentialité 2019-09-30 2021-09-30 confidentialité 2019-09-30 2021-09-30 confidentialité 2019-09-30 2021-09-30 confidentialité 2019-09-30 2021-09-30