Note ABES Deciphering the interactions between plants and bacteria in the context of isoprenoid biosynthesis in Arabidopsis thaliana Etude des interactions plantes-bactéries dans le contexte de la biosynthèse des isoprénoïdes chez Arabidopsis thaliana Isoprénoïdes Interactions plantes-bactéries Microbiote Pseudomonas syringae Arabidopsis thaliana Isoprenoids Plant-bacteria interactions Microbiota Pseudomonas syringae Arabidopsis thaliana 579.3 577.8 Isoprénoïdes Biosynthèse Bactéries phytopathogènes Relations hôte-bactérie Arabidopsis thaliana Les isoprénoïdes constituent une grande classe de molécules que l'on retrouve chez tous les organismes vivants et qui sont impliquées dans divers processus biologiques. Le but de ma thèse était de déterminer si ces molécules pouvaient être impliquées dans les interactions entre plantes et bactéries. J'ai travaillé sur des plantes Arabidopsis thaliana sauvages, et sur deux mutants affectés dans chacune des deux voies de biosynthèse des isoprénoïdes existant chez les plantes supérieures. Un inventaire des communautés constituant le microbiote de ces plantes a mis en évidence certaines bactéries dont l’abondance varie dépendamment du génotype, malgré l'existence d'un microbiote commun entre plantes sauvages et mutantes. De plus, il a été démontré que les plantes affectées dans la voie de biosynthèse plastidiale, dite du méthylérythritol phosphate (MEP), sont plus sensibles que les plantes sauvages à l’infection par Pseudomonas syringae, un phytopathogène bien connu. Ensemble, ces résultats suggèrent que les isoprénoïdes peuvent jouer un rôle dans les interactions entre plantes et bactéries. D’autre part, 230 souches interagissant avec A. thaliana ont été isolées au laboratoire, parmi lesquelles certaines ont été testées pour déterminer leur effet sur le phénotype et la résistance des plantes à P. syringae, ainsi que l’effet des isoprénoïdes sur ces souches. Isoprenoids are a large class of molecules found in all living organisms that are implicated in diverse biological processes. The aim of my thesis was to decipher if they could be involved in the interactions between plants and bacteria. Therefore, I worked on Arabidopsis thaliana wild-type and mutants, altered in the two isoprenoid biosynthesis pathways occurring in higher plants. An inventory of the communities interacting with wild-type and mutants highlighted some differentially abundant bacteria, despite the existence of a core microbiota. In addition, plants affected in the plastidial biosynthesis pathway, referred as the methylerythritol phosphate (MEP) pathway, have been shown to be more affected than wild-type by Pseudomonas syringae, a well-known phytopathogen. Together, these results suggest that isoprenoids may play a role in the interactions between plants and bacteria. In addition, 230 strains were isolated from A. thaliana in the laboratory, among which some of them were tested for their impact on the plant fitness and resistance to P. syringae, and for the impact on isoprenoids on these strains. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 7652434 Université de Strasbourg Strasbourg 2020-12-31 https://theses.hal.science/tel-02968590 application/pdf 7792734 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2019/groh_chloe_2019_ED414.pdf http://www.theses.fr/2019STRAJ079/abes https://theses.hal.science/tel-02968590 https://theses.hal.science/tel-02968590 https://theses.hal.science/tel-02968590 https://theses.hal.science/tel-02968590 Groh Chloé 1992-05-27 FR 248345559 https://theses.fr/2019STRAJ079 2019STRAJ079 https://doi.org/10.70675/a5bfcc28za7f2z4fc8z8959zdcba62cb6fc5 2019-10-15 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Arsène-Ploetze Florence MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 155240994 Heintz Dimitri MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 176830391 Prigent-Combaret Claire MADS_PRESIDENT_DU_JURY 125913591 Arsène-Ploetze Florence MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 155240994 Heintz Dimitri MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 176830391 Prigent-Combaret Claire MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 125913591 Peyret Pierre MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 139566066 Geoffroy Valérie MADS_MEMBRE_DU_JURY_5 138968799 Heipieper Hermann J. MADS_MEMBRE_DU_JURY_6 113127995 Prigent-Combaret Claire MADS_RAPPORTEUR_1 125913591 Peyret Pierre MADS_RAPPORTEUR_2 139566066 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 Arsène-Ploetze Florence Heintz Dimitri Prigent-Combaret Claire Arsène-Ploetze Florence Heintz Dimitri Prigent-Combaret Claire Peyret Pierre Geoffroy Valérie Heipieper Hermann J. Prigent-Combaret Claire Peyret Pierre École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 7652434 restriction 2019-10-15 2020-10-15 restriction 2019-10-15 2020-10-15