Note ABES Entre silence, naissance et dégradation : vers la caractérisation de nouveaux mécanismes relatifs à la biologie des ARN de transfert et assurant l'homéostasie de la cellule végétale. Between silence, birth and degradation : towards the characterization of new mechanisms related to transfer RNA biology and ensuring plant cell homeostasis ARNt ARNt-like Génome 3D Épigénétique TRF RNases T2 Trafic subcellulaire TRNAs TRNAs-like 3D genome Epigenetic TRFs RNAses T2 Subcellular trafficking 572.8 581 Génomique ARN de transfert Ribonucléases Arabidopsis thaliana Métabolisme -- Génétique Mon projet de thèse visait à caractériser de nouveaux aspects physiologiques relatifs à la biologie des ARN de transfert (ARNt) chez les plantes. Il se composait de deux chapitres. Le premier chapitre avait pour objectif de décrire d’un point de vue évolutif l’organisation génomique des gènes d’ARNt nucléaires (ADNt) de plantes, et caractériser les pendants moléculaires régulant leur expression. Par rapport aux autres organismes vivants, ce travail a permis de révéler une haute organisation des ADNt sur les chromosomes de plantes se caractérisant par : des déserts géniques au niveau des centromères, des distances inter-ADNt homogènes, et la présence de clusters d’ADNt répétés. Aussi, ce travail a permis de décrire les premières évidences d’un silencing épigénétique de l’expression d’ADNt de plantes organisés en clusters de répétitions. La conjonction de ces résultats suggère un rôle potentiel des ADNt dans l’orchestration des génomes tridimensionnels de plantes. Le deuxième chapitre avait pour objectif de caractériser la biogenèse et les fonctions de petits ARN non-codants dérivant d’ARNt, les tRF, chez A. thaliana. Ce travail a permis de montrer que les RNases T2 sont les principaux acteurs de leur biogenèse. My thesis project aimed at figuring out new physiological aspects related to transfer RNA (tRNAs) biology in plants. It was divided in two parts. The first one consisted in describing from an evolutionarily point of view the genomic layout of plant tRNA genes (tDNAs) onto nuclear chromosomes. Contrasting with non-plant organisms, plant nuclear tDNAs exhibit a higher order in their chromosomal scattering. This is due to centromeric regions exclusion combined to highly conserved inter-tDNA distances and tDNA repeat clusters occurrences. Moreover, that part consisted in deciphering elements of nuclear tDNA transcriptional regulation. We brought evidences of epigenetic silencing mechanisms at clustered tDNA loci. As a perspective, we propose tDNAs might play a role in three-dimensional genomes orchestration. The second aspect referred to characterizing the biogenesis and functions of small non-coding RNAs deriving from tRNAs: tRFs. The results obtained demonstrate that RNases T2 as the predominant molecular actors for their biogenesis. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 107090266 Université de Strasbourg Strasbourg 2020-12-31 application/pdf 883708846 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2019/HUMMEL_Guillaume_2019_ED414.pdf http://www.theses.fr/2019STRAJ101/abes Hummel Guillaume 1993-12-03 FR 248670956 https://theses.fr/2019STRAJ101 2019STRAJ101 https://doi.org/10.70675/c349f8ecz721ez40f7z8ff6zd0754e9a03eb 2019-12-18 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Drouard Laurence MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 060734949 Pfeffer Sébastien MADS_PRESIDENT_DU_JURY 069221928 Drouard Laurence MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 060734949 Pfeffer Sébastien MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 069221928 Probst Aline MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 181169118 Vaucheret Hervé MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 08929128X Probst Aline MADS_RAPPORTEUR_1 181169118 Vaucheret Hervé MADS_RAPPORTEUR_2 08929128X École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 ddc:580 Drouard Laurence Pfeffer Sébastien Drouard Laurence Pfeffer Sébastien Probst Aline Vaucheret Hervé Probst Aline Vaucheret Hervé École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 107090266 confidentialité 2019-12-18 2020-12-31 confidentialité 2019-12-18 2020-12-31 restriction 2019-12-18 2021-01-29 restriction 2019-12-18 2021-01-29 confidentialité 2019-12-18 2020-12-31