Influence de l’uridylation sur la déadénylation des ARN messagers chez Arabidopsis thaliana
Langue Anglais
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Auteur : De Almeida, Caroline
Date de soutenance : 30-09-2019

Directeur(s) de thèse : Gagliardi, Dominique

Président : Wachter, Andreas
Rapporteur(s) : Wachter, Andreas - Vaňáčová, Štěpánka
Membre(s) du jury : Gagliardi, Dominique - Wachter, Andreas - Vaňáčová, Štěpánka - Mauxion, Fabienne

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moleculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : Uridylation, Déadénylation, ARNm, TUTases, URT1, Dégradation des ARN, Arabidopsis thaliana
Mots-clés :
  • Plantes -- Expression génique
  • ARN -- Modifications posttranscriptionnelles
  • Nucléotidyltransférases
  • Arabidopsis thaliana
Résumé : L’uridylation des ARN est une modification post-transcriptionnelle qui consiste en l’ajout d’uridines aux extrémités 3’ des ARN codants et non-codants. La fonction principale décrite pour l’uridylation est la stimulation de la dégradation des ARN cibles. Cependant, les processus moléculaires responsables de cette stimulation sont encore peu connus. Mes travaux de thèse ont eu pour but la caractérisation de la fonction moléculaire de URT1, la principale uridylyltransferase terminale qui uridyle les ARN messagers (ARNm) chez Arabidopsis thaliana. Mes résultats démontrent que URT1 module le profil de polyadenylation des ARNm de deux manières. Premièrement, l’ajout d’uridines en 3‘ des ARNm par URT1 freine la déadénylation et entraîne l’accumulation de queues polyadénylées (polyA) plus longues. Deuxièmement, URT1 est impliqué dans la dégradation d’ARNm uridylés ayant une queue polyA courte de 10-20 nucléotides. Un motif peptidique M1 dans la région N-terminale de URT1 est impliqué dans la dégradation de cette population d’ARNm. Ce motif recrute DCP5, un activateur de l’élimination de la coiffe, qui pourrait stimuler l’élimination de la coiffe et favoriser la dégradation de 5’-3’ de ces ARN cibles. Ainsi, les fonctions d’URT1 sont essentielles pour favoriser la dégradation de 5’-3’ et prévenir l’accumulation délétère d’ARNm excessivement déadenylés et tronqués en 3’.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2019STRAJ126
Type de ressource : Thèse