Codes circulaires dans l'évolution du code génétique
Circular codes in the evolution of the genetic code
Codes circulaires
Codes circulaires des dinucléotides
Codes circulaire des trinucléotides
Codes circulaires des tétranucléotides
Propriétés des graphiques
Circular codes
Dinucleotide circular codes
Trinucleotide circular codes
Tetranucleotide circular codes
Graph properties
004
572.86
Génétique
Génome
Le problème abordé dans cette thèse est de savoir comment retrouver, maintenir et synchroniser la phase de lecture pendant la traduction des gènes en protéines. La traduction est le processus par lequel le ribosome décode l’ARN messager (une séquence de nucléotides {A, C, G,T}) en codons (3 nucléotides) pour créer une protéine. L’ARN messager peut être décodé en trois phases 0, +1 et +2 mais uniquement la phase 0 (phase de lecture) initiée par un ”start” codon code les informations pour synthétiser les protéines. Un code (ensemble de mots) avec la propriété de circularité permet de retrouver la phase de lecture. Un code circulaire, nommé X, formé de 20 trinucléotides a été découvert en 1996 par une analyse statistique des gènes de différentes espèces. Dans ce livre, je présente les nouvelles propriétés des codes circulaires. Sur la base de ces propriétés, je présente une ligne directrice hypothétique qui peut aider à découvrir l'évolution de la synthèse des protéines.
The problem that this work addresses is how to retrieve, maintain and synchronize the correct reading frame during the translation process. Translation is the process by which the ribosome decodes the messenger RNA (sequence of nucleotides {A,C,G,T}) as codons (word of 3 nucleotides) to create a specific amino acid chain. Unfortunately, the mRNA can be decoded in three reading frames 0, +1 and +2. Yet, only frame 0 as correct reading frame encodes the Information for the synthesis of proteins. First practical evidence of a genetic model which is able to retrieve the correct reading frame is the so-called X-code. Astonishingly, it turned out that the X-code is a circular code. The advantages of circular genetic codes are incomparable. In this work I introduce new properties. Based on these properties I present a hypothetical guiding line which can help to discover the evolution of protein synthesis.
Electronic Thesis or Dissertation
Text
en
PDF
4267208
Université de Strasbourg
Strasbourg
2022-12-31
https://theses.hal.science/tel-03638355
application/pdf
4223819
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2020/Starman_Martin_2020_ED269.pdf
http://www.theses.fr/2020STRAD043/abes
https://theses.hal.science/tel-03638355
https://theses.hal.science/tel-03638355
https://theses.hal.science/tel-03638355
Starman
Martin
1987-11-17
DE
261743740
https://theses.fr/2020STRAD043
2020STRAD043
https://doi.org/10.70675/3ab91a69z3546z4072zb7ddzbe17cd5be7f4
2020-12-11
Informatique
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Michel
Christian
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1
155859870
Strüngmann
Lutz
MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2
202909654
Fimmel
Elena
MADS_PRESIDENT_DU_JURY
202909433
202909433
Sereni
Jean-Sébastien
MADS_MEMBRE_DU_JURY_1
110354540
Denise
Alain
MADS_RAPPORTEUR_1
035353368
Giannerini
Simone
MADS_RAPPORTEUR_2
261744364
École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....)
MADS_ECOLE_DOCTORALE_1
156504863
Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg ; 2013-....)
MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1
176969721
260728
ddc:004
ddc:570
Michel
Christian
Strüngmann
Lutz
Fimmel
Elena
Sereni
Jean-Sébastien
Denise
Alain
Giannerini
Simone
École doctorale Mathématiques, sciences de l'information et de l'ingénieur (Strasbourg ; 1997-....)
Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (Strasbourg)
PDF
4267208