Note ABES Synthèse chimique totale et études biophysiques du domaine de transactivation de la protéine p53 et de ses analogues Total chemical synthesis and biophysical studies of transactivation domain of p53 protein (p53TAD) and its analogues Protéines intrinsèquement désordonnées TAD-p53 Biophysique Synthèse chimique Intrinsically disordered proteins P53-TAD Biophysics Chemical synthesis 541.3 572.6 Synthèse protéique Repliement des protéines Dynamique moléculaire Activation de la transcription Dissertation universitaire Protéines intrinsèquement désordonnées Dissertation universitaire Le domaine N-terminal de transactivation de la protéine p53 (p53TAD) joue un rôle crucial dans les interactions nécessaires à l’initiation de la transcription des gènes répondant aux stress cellulaires. Cette thèse a pour but de disséquer les mécanismes responsables de l’interaction et de la formation du complexe entre la protéine intrinsèqement désordonnée p53TAD et le domaine de liaison du coactivator nucléaire (NCBD) de CBP. Pour cela, des méthodes de synthèses chimiques combinatoires et de caractérisations biophysiques ont été utilisées. Nous avons conçu une nouvelle méthodologie robuste pour la synthèse chimique de la protéine p53TAD à partir de la combinaison entre la SPPS et la ligation chimique native. Nous avons aussi évalué le repliement couplé à l’association de p53TAD et de NCBD en utilisant des variants de p53TAD contenant des modifications post-traductionnelles et du squelette protéique. Dans cette thèse, nous avons aussi décrit une nouvelle stratégie pour la synthèse en parallèle de larges librairies de protéines. Nous espèrons que les stratégies exposées lors de ces travaux de thèse nous aideront à mieux comprendre la complexité des paramètres biophysiques qui contrôlent les protéines intrinsèquement désordonnées. The N-terminal transactivation domain of p53 (p53TAD) mediates crucial interactions necessary for the initiation of transcription of p53-responsive genes upon cellular stress. This thesis aims to dissect the underlying mechanism of binding and complex formation between intrinsically disordered p53TAD and Nuclear coactivator binding domain of (NCBD) of CBP through a combination of chemical synthesis and biophysical studies. We devised a novel and robust methodology for the chemical synthesis of p53TAD through a combination of SPPS and native chemical ligation. Besides, we also probed the coupled folding and binding of p53TAD with NCBD using p53TAD variants containing post-translational and backbone modifications. In this thesis, we also describe a novel strategy for the synthesis of extensive protein libraries. We expect that the strategies put forwards in this thesis will help us to understand the puzzling biophysics of intrinsically disordered proteins. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 8112958 Université de Strasbourg Strasbourg 2021-12-31 application/pdf 7841843 http://www.theses.fr/2020STRAF010/document/ https://theses.fr/2020STRAF010/abes Asokan Aromal 1993-04-26 IN 255978510 https://theses.fr/2020STRAF010 2020STRAF010 https://doi.org/10.70675/3741a9c8z54f4z4173z92f8z54ff6881fc6c 2020-06-30 Chimie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Torbeev Vladimir MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 231409664 Aucagne Vincent MADS_PRESIDENT_DU_JURY 077138120 Zanier Katia MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 236279076 Aucagne Vincent MADS_RAPPORTEUR_1 077138120 Bernadó Pau MADS_RAPPORTEUR_2 199227071 École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156504081 Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157760227 207480 ddc:540 ddc:570 Torbeev Vladimir Aucagne Vincent Zanier Katia Aucagne Vincent Bernadó Pau École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) Institut de science et d’ingénierie supramoléculaires (Strasbourg) PDF 8112958 confidentialité 2020-06-30 2028-06-30 confidentialité 2020-06-30 2028-06-30 confidentialité 2020-06-30 2028-06-30 confidentialité 2020-06-30 2028-06-30