Cinétique de réactivation de la transcription et réorganisation de la structure de la chromatine après la mitose
Transcription reactivation kinetics and chromatin structure reorganization after mitosis
Organisation tridimensionnelle de la chromatine
Régulation de la machinerie transcriptionnelle
Hi-C
RNA-Seq
Mitose
Three-dimensional organization of chromatin
Regulation of the transcriptional machinery
RNA-Seq
Hi-C
Mitosis
570.28
572.8
Bioinformatique
Mitose
Chromatine
Transcription génétique
Séquençage des acides nucléiques
Analyse des données
Dans cette thèse, nous avons tenté de découvrir le lien existant entre l'organisation tridimensionnelle de la chromatine et la régulation de la machinerie transcriptionnelle, en combinant des analyses informatiques et la modélisation mathématique de données provenant d'expériences à haut débit telles que le RNA-Seq et le Hi-C. Ces recherches visent principalement à mettre en évidence les principaux régulateurs responsables de la réactivation de la transcription à la sortie de la mitose, et à identifier les facteurs les plus importants de la réorganisation structurelle de la chromatine dans le cycle cellulaire.
In this thesis, we tried to uncover the existing link between the three-dimensional organization of chromatin and the regulation of the transcriptional machinery, by combining computational analyses and mathematical modeling of data from high-throughput experiments, such as RNA-Seq and Hi-C. In particular, the aims of this research are to reveal the key regulators responsible for the reactivation of the transcription exiting the mitosis, and to infer the most important factors driving the structural reorganization of the chromatin through the cell-cycle.
Electronic Thesis or Dissertation
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6742701
Université de Strasbourg
Strasbourg
2021-12-31
https://theses.hal.science/tel-03501751
application/pdf
6696852
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2020/Sarnataro_Sergio_2020_ED414.pdf
http://www.theses.fr/2020STRAJ014/abes
https://theses.hal.science/tel-03501751
https://theses.hal.science/tel-03501751
https://theses.hal.science/tel-03501751
Sarnataro
Sergio
1989-07-26
FR
250393964
https://theses.fr/2020STRAJ014
2020STRAJ014
https://doi.org/10.70675/b5a180fcz9668z412fz8888z30a9070e1fef
2020-06-05
Bioinformatique et biologie des systèmes
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Molina
Nacho
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259235253
Sexton
Thomas
MADS_PRESIDENT_DU_JURY
227420705
Molina
Nacho
MADS_MEMBRE_DU_JURY_1
259235253
Sexton
Thomas
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Stadler
Michael
MADS_MEMBRE_DU_JURY_3
25923527X
Zavolan
Mihaela
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Stadler
Michael
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25923527X
Zavolan
Mihaela
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École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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156502844
Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
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Molina
Nacho
Sexton
Thomas
Molina
Nacho
Sexton
Thomas
Stadler
Michael
Zavolan
Mihaela
Stadler
Michael
Zavolan
Mihaela
École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
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