Etude du rôle d'une nouvelle endoribonucléase à domaine NYN dans la dégradation des ARN chez Arabidopsis thaliana
Characterization of a novel NYN endoribonuclease involved in RNA degradation in Arabidopsis thaliana
Dégradation des ARN
Endoribonucléase
Domaine NYN
Decapping
DCP1
Arabidopsis thaliana
RNA degradation
Endoribonuclease
NYN domain
Decapping
DCP1
Arabidopsis thaliana
572.8
581
Arabidopsis thaliana
Cytogénétique
Mitochondries végétales
ARN messagers
Détérioration
Ribonucléases
Les mécanismes de dégradation des ARN ont un rôle majeur afin d’assurer la régulation de l’expression des gènes. Ces phénomènes sont cruciaux lors des transitions développementales et en conditions de stress biotiques et abiotiques. Au cours de ma thèse j’ai caractérisé une nouvelle endoribonucléase à domaine NYN, DAE (DCP1 Associated Endoribonuclease). J’ai montré que DAE interagit directement avec l’activateur de decapping DCP1. L’analyse du transcriptome de plantes dans lesquelles l’expression de DAE est altérée suggère qu’elle agit en parallèle du complexe de decapping. Mes résultats révèlent l’existence d’un nouveau complexe, distinct du complexe de decapping canonique et dont DAE est la sous-unité catalytique. L’étude de la fonction biologique de cette nouvelle voie de dégradation des ARNm permettra de mieux comprendre comment ces mécanismes sont orchestrés chez les plantes afin de répondre à des modifications de leur environnement.
RNA degradation pathways have a major role in the regulation of gene expression. These mechanisms are crucial determinants of developmental transitions and in the plant response to biotic and abiotic stresses. During my PhD, I characterized a hitherto unknown NYN domain endoribonuclease, DAE (DCP1 Associated Endoribonuclease). I established that DAE interacts directly with the decapping activator DCP1. The transcriptomic analysis of plants with altered DAE expression, strongly suggest that it acts in parallel of the decapping complex. Overall my results reveal the existence of a new complex distinct from the canonical decapping complex, in which DAE is the catalytic subunit. Studying the biological function of this new complex will improve our understanding of how RNA degradation pathways in plants are orchestrated to respond to environmental stimuli.
Electronic Thesis or Dissertation
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fr
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6017538
Université de Strasbourg
Strasbourg
2021-12-31
https://theses.hal.science/tel-04213478
application/pdf
https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2020/Schiaffini_Marlene_2020_ED414.pdf
http://www.theses.fr/2020STRAJ016/abes
https://theses.hal.science/tel-04213478
https://theses.hal.science/tel-04213478
https://theses.hal.science/tel-04213478
https://theses.hal.science/tel-04213478
Schiaffini
Marlène
1990-05-12
IT
259237361
https://theses.fr/2020STRAJ016
2020STRAJ016
https://doi.org/10.70675/9686bcf9zcabez4eedzaba8z223b774e2da4
2020-06-12
Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Strasbourg
131056549
Doctorat
Docteur es
non
oui
Garcia
Damien
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Lagrange
Thierry
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Garcia
Damien
MADS_MEMBRE_DU_JURY_1
113678207
Lagrange
Thierry
MADS_MEMBRE_DU_JURY_2
096199482
Brodersen
Peter
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204247543
Frugier
Magali
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160427703
Lagrange
Thierry
MADS_RAPPORTEUR_1
096199482
Brodersen
Peter
MADS_RAPPORTEUR_2
204247543
École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
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156502844
Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
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444
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Garcia
Damien
Lagrange
Thierry
Garcia
Damien
Lagrange
Thierry
Brodersen
Peter
Frugier
Magali
Lagrange
Thierry
Brodersen
Peter
École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
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