Note ABES Functional interactions of nuclear RNase P in Arabidopsis thaliana Interactions fonctionnelles des RNase P nucléaires chez Arabidopsis thaliana RNase P ARN de transfert (ARNt) TLS MAF1 Arabidopsis thaliana RNase P Transfer RNA (tRNA) TLS MAF1 Arabidopsis thaliana 572.8 581 ARN de transfert Arabidopsis thaliana Plantes -- Génétique moléculaire Ribonuclease P Dissertation universitaire La RNase P est une enzyme essentielle qui mature l’extrémité 5’ des précurseurs d’ARN de transfert. Ma thèse a visé à caractériser les interactions fonctionnelles de la RNase P nucléaire (PRORP2) chez Arabidopsis thaliana. Le réseau d’interaction protéine / protéine de PRORP2 a ainsi été déterminé, en démontrant que PRORP2 interagit fonctionnellement avec les tRNA methyltransférases 1A et 1B pour produire son activité sur les précurseurs d’ARNt. Ce résultat permet de mieux comprendre les étapes précoces de la maturation des ARNt chez les plantes. De plus, un nouveau substrat ARN de PRORP2 a été identifié. Il s’agit de l’ARN messager du gène MAF1 qui contient une structure ressemblant à un ARNt ou TLS pour « tRNA like structure ». Mes résultats démontrent que le TLS de MAF1 est un substrat in vitro et in vivo pour PRORP2. Ce qui permet de soutenir l’hypothèse que PRORP2 clive l’ARNm de MAF1, soit pour générer un nouveau petit ARN non codant, soit pour réguler le niveau d’expression du gène MAF1. MAF1 étant le principal régulateur négatif de l’ARN polymérase III, qui transcrit les ARNt, PRORP2 pourrait ainsi réguler indirectement l’activité de la polymérase III chez Arabidopsis thaliana. RNase P is an essential enzyme that maturates the 5’ leader sequence of tRNA precursors. My PhD project aimed at characterizing the functional interactions of nuclear RNase P (PRORP2) in Arabidopsis thaliana. The protein-protein network of interaction of PRORP2 was determined by co-immunoprecipitation and our results show that PRORP2 interacts with two tRNA methyltransferases (TRM1A and B) to properly maturate precursors tRNAs. This result gives new insights on the first steps of pre-tRNA processing in land plants. Moreover, a new RNA substrate of PRORP2 was discovered. It is a tRNA like structure (TLS) located in the messenger RNA of the MAF1 gene. My results show that MAF1 TLS is PRORP2 substrate in vitro and in vivo. This allow us to generate the hypothesis that PRORP2 cleaves MAF1 TLS, either to generate a new non-coding RNA or to regulate the level of expression of the MAF1 gene. As MAF1 is the main known negative regulator of RNA polymerase III (that transcribes tRNA), this could mean that PRORP2 regulates RNA pol. III activity in Arabidopsis thaliana. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 6433230 Université de Strasbourg Strasbourg 2022-12-31 https://theses.hal.science/tel-03598649 application/pdf 6092581 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2020/Bruggeman_Mathieu_2020_ED414.pdf http://www.theses.fr/2020STRAJ031/abes https://theses.hal.science/tel-03598649 https://theses.hal.science/tel-03598649 https://theses.hal.science/tel-03598649 Bruggeman Mathieu 1984-06-17 FR 260806935 https://theses.fr/2020STRAJ031 2020STRAJ031 https://doi.org/10.70675/97c7065dzf843z463fzb566z54050653b83d 2020-12-10 Sciences de la vie et de la santé Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Giegé Philippe MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 152079335 Gobert Anthony MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 260806943 Frugier Magali MADS_PRESIDENT_DU_JURY 160427703 160427703 Giegé Philippe MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 152079335 Gobert Anthony MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 260806943 Frugier Magali MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 160427703 160427703 Boguta Magdalena MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 155974394 Schmitz-Linneweber Christian MADS_MEMBRE_DU_JURY_5 257414282 Bousquet-Antonelli Cécile MADS_MEMBRE_DU_JURY_6 171497244 171497244 Boguta Magdalena MADS_RAPPORTEUR_1 155974394 Schmitz-Linneweber Christian MADS_RAPPORTEUR_2 257414282 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 156775727 444 ddc:570 ddc:580 Giegé Philippe Gobert Anthony Frugier Magali Giegé Philippe Gobert Anthony Frugier Magali Boguta Magdalena Schmitz-Linneweber Christian Bousquet-Antonelli Cécile Boguta Magdalena Schmitz-Linneweber Christian École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) PDF 6433230