Note ABES The role of SAGA deubiquitinase module in transcriptional regulation Le rôle du module de deubiquitination SAGA dans la régulation de la transcription Régulation transcriptionnelle Développement embryonnaire ATXN7L3 H2Bub1 Pol II Transcriptional regulation Embryonic development ATXN7L3 H2Bub Pol II 572.8 Développement embryonnaire Dissertation universitaire Transcription génétique Éléments de régulation transcriptionnelle Dissertation universitaire L’ensemble des protéines du DUBm de SAGA sont requises pour le clivage de molécules d’histones H2Bub1, nous étudions le rôle du DUBm de SAGA dans la régulation de la transcription. Nous avons démontré que la protéine ATXN7L3 est essentielle pour le développement embryonnaire. Pour avoir un meilleur aperçu de la fonction d’ATXN7L3, nous avons effectué des expériences de différentiation de mESC en l’absence d’ATXN7L3. Nous avons observé qu’ATXN7L3 promeut la différenciation des mESC en cardiomyocytes, mais pas en précurseurs de l’ectoderme neural. De ce fait, ATNX7L3 pourrait fonctionner de manière tissue-spécifique. En outre, nous avons effectué des analyses transcriptionnelles et ChIP-seq de mESC Atxn7l3-/-. De façon inattendue, les niveaux de H2Bub1 sont significativement plus élevés dans le corps de l’ensemble des gènes transcrits en l’absence d’ATXN7L3. Cependant, l’occupation de l’ARN polymérase II sur l’ensemble de ces gènes ne varie que modestement dans ces cellules Atxn7l3-/-. Ainsi, la déubiquitination de H2Bub1 ne régule pas directement la transcription par l’ARN polymérase II de l’ensemble du génome. The deubiquitylation module of SAGA is required for the removal of mono-ubiquitin from histone H2B. Here we investigated the role of SAGA deubiquitinase module in transcriptional regulation. We found that Atxn7l3 is essential for embryonic development. To get better insight into ATXN7L3, we carried out mESC differentiation assays. Our results showed that ATXN7L3 promoted the differentiation of cardiomyocyte cells, but not ectoderm neural precursor. Thereby, ATXN7L3 might function in a tissue-specific manner. To understand the molecular mechanisms underlying these phenotypes, we performed transcriptomic and ChIP-Seq analyses from Atxn7l3-/- mESC. Unexpectedly, although H2Bub1 levels significantly increased in the gene body of every expressed gene, the genome-wide occupancy of Pol II was only modestly changed in Atxn7l3-/- mESCs. Thus, H2Bub1 deubiquitination did not directly regulate global Pol II transcription. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 8472287 Université de Strasbourg Strasbourg 2022-12-31 https://theses.hal.science/tel-03605572 application/pdf 8377624 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2020/WANG_Fang_2020_ED414.pdf http://www.theses.fr/2020STRAJ069/abes https://theses.hal.science/tel-03605572 https://theses.hal.science/tel-03605572 https://theses.hal.science/tel-03605572 Wang Fang 1989-12-26 CN 260929956 https://theses.fr/2020STRAJ069 2020STRAJ069 https://doi.org/10.70675/8c77105dz96d8z46f4z8354z1e622ff20fbf 2020-12-04 Développement et physiologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Tora Laszlo MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 069776113 Sumara Izabela MADS_PRESIDENT_DU_JURY 178330132 178330132 Tora Laszlo MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 069776113 Sumara Izabela MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 178330132 178330132 Gérard Matthieu MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 10936581X Borggrefe Tilman MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 190858222 190858222 Brou Christel MADS_MEMBRE_DU_JURY_5 118278061 077462971 Gérard Matthieu MADS_RAPPORTEUR_1 10936581X Borggrefe Tilman MADS_RAPPORTEUR_2 190858222 190858222 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Tora Laszlo Sumara Izabela Tora Laszlo Sumara Izabela Gérard Matthieu Borggrefe Tilman Brou Christel Gérard Matthieu Borggrefe Tilman École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 8472287 confidentialité 2020-12-04 2021-08-01 confidentialité 2020-12-04 2021-08-01 restriction 2020-12-04 2021-12-01 restriction 2020-12-04 2021-12-01 confidentialité 2020-12-04 2021-08-01