Note ABES Etude de l'interactome ARN-ARN chez Staphylococcus aureus : caractérisation, fonction et impact sur les réseaux de régulation Study of Staphylococcus aureus RNA-RNA interactome : characterization, function and impact on regulatory networks Staphylococcus aureus ARN régulateurs (sARN) Métabolisme Interactome Staphylococcus aureus Regulatory RNA (sRNA) Metabolism Interactome 572.8 579.3 Staphylocoque doré Métabolisme -- Régulation Ligands (biochimie) -- Fixation Aptamères nucléotidiques Séquences d'acides nucléiques régulatrices Mon projet de thèse a été de caractériser la fonction de deux sARN, appelés RsaG et RsaI de Staphylococcus aureus, un pathogène opportuniste de l’homme. RsaG est dérivé de la région 3’ non traduite de l’ARNm uhpT, codant pour un transporteur du glucose-6-phosphate, une source de carbone majeur. L’expression de RsaI, dépend également de la présence d’un autre sucre d’importance. En effet, RsaI est inhibé en présence de fortes concentrations de glucose. L’étude révèlent une interaction originale entre RsaI et RsaG. Les résultats semble également indiquer que l’expression de RsaI est une signature d’un changement métabolique qui s’opère chez S. aureus lorsque le glucose est épuisée du milieu. RsaG quant à lui, est apparu comme connectant l’homéostasie rédox avec l’adaptation métabolique. Deuxièmement, le projet avait aussi comme objectif d’établir une méthode pour cartographier l’ensemble des interactions ARN-ARN à l’échelle du génome de S. aureus, dans le but d’obtenir une vue globale de la physiologie de cet organisme. The primary aim of the project was to characterize the function of two sRNAs, called RsaG and RsaI of Staphylococcus aureus, a human opportunistic pathogen. RsaG is a so-called 3’UTR derived sRNA because it is located in the 3’ untranslated region of the uhpT gene encoding a glucose-6-phosphate, a major carbon source. Then the expression of RsaI, also depends on the presence of another important sugar. Indeed, RsaI is inhibited in the presence of high concentrations of glucose. The study reveals an original interaction between RsaI and RsaG. The results also seem to indicate that that RsaI expression provides a signature for the bacterial metabolic switch when glucose is depleted. RsaG on the other hand appears to connect redox homeostasis and metabolism adaptation. Secondly, the project also attempts to establish an approach to map all RNA-RNA genome-wide interactions of S. aureus in order to obtain a global view of the physiology of this organism. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 67507891 Université de Strasbourg Strasbourg 2021-12-31 https://theses.hal.science/tel-03504785 application/pdf 67507881 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2020/Desgranges_Emma_2020_ED414.pdf http://www.theses.fr/2020STRAJ076/abes https://theses.hal.science/tel-03504785 https://theses.hal.science/tel-03504785 https://theses.hal.science/tel-03504785 Desgranges Emma 1992-12-15 FR 257497595 0803025704B 21404285 4200047 https://theses.fr/2020STRAJ076 2020STRAJ076 https://doi.org/10.70675/d775c3c2z168az4084zbefcz1f0b01675ede 2020-09-17 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Romby Pascale MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 031545009 Caldelari Baumberger Isabelle MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_2 257497986 Frugier Magali MADS_PRESIDENT_DU_JURY 160427703 Romby Pascale MADS_MEMBRE_DU_JURY_1 031545009 Caldelari Baumberger Isabelle MADS_MEMBRE_DU_JURY_2 257497986 Frugier Magali MADS_MEMBRE_DU_JURY_3 160427703 Condon Ciarán MADS_MEMBRE_DU_JURY_4 117446394 Repoila Francis MADS_MEMBRE_DU_JURY_5 114503362 Condon Ciarán MADS_RAPPORTEUR_1 117446394 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Romby Pascale Caldelari Baumberger Isabelle Frugier Magali Romby Pascale Caldelari Baumberger Isabelle Frugier Magali Condon Ciarán Repoila Francis Condon Ciarán École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 67507891 restriction 2020-09-17 2021-10-01 restriction 2020-09-17 2021-10-01