Identification des nouvelles protéines et ncRNA CTIP2 interactants dans les cellules microgliales
Langue Anglais
Accéder au document

Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.

 
Auteur : Rovere, Marco de
Date de soutenance : 02-12-2020

Directeur(s) de thèse : Rohr, Olivier

Président : Paillart, Jean-Christophe
Rapporteur(s) : Herbein, Georges - Marban, Céline
Membre(s) du jury : Kula-Pacurar, Anna

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Dynamique des interactions hôte pathogène (Strasbourg ; 2013-2023)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie, Médecine et santé

Mots-clés libres : CTIP2, Bcl11b, PSF, SFPQ, VIH-1, Réservoir viral, ARN
Mots-clés :
  • VIH-1 (Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1) - Dissertation universitaire
  • Transcription génétique
Résumé : Le projet principal de cette thèse a suivi l'identification de nouvelles interactions de la protéine CTIP2 avec les ARN et les protéines. CTIP2 a été décrit par une expérience précédente effectuée dans notre laboratoire comme étant un régulateur négatif de la transcription des gènes du VIH-1 dans les cellules microgliales. Notre groupe a également réussi à décrire le CTIP2 faisant partie de deux complexes différents qui étaient capables d'induire et de maintenir un état répresseur sur le promoteur viral du provirus VIH-1 intégré et d'entraver sa réactivation. Avec ce projet, j'ai pu identifier une multitude de nouveaux partenaires et démarrer différents projets parallèles dans le but d'étudier l'interaction de ces protéines et ARN avec CTIP2 dans le cycle de réplication du VIH-1 et la latence virale. Parmi les résultats, nous avons pu décrire une forte interaction de CTIP2 avec la protéine PSF / SFPQ, trouver une forte colocalisation de ces deux protéines et identifier un effet intéressant des deux protéines ensemble dans la transcription des gènes du VIH-1. De plus, les deux protéines ont montré qu'elles partageaient une interaction avec d'autres protéines et ARN obtenus lors du premier criblage réalisé au début de ce projet. D'autres interactions intéressantes ont également été observées avec des protéines de la famille YTHDF reliant CTIP2 à la machinerie de modification post-transcriptionnelle sur les ARN tels que la modification N6-méthyladénosine portée par de nombreux ARN. Une autre série d'expériences issues du criblage initial de l'ARN interagissant avec CTIP2 a été réalisée pour confirmer l'interaction de ces protéines avec l'ARN nc avec des fonctions biologiques intéressantes telles que NEAT1, MALAT1, 7SK. MEG3, SNORD133 et U11.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2020STRAJ086
Type de ressource : Thèse