Développements méthodologiques en analyse protéomique : vers une analyse à haut débit sur des quantités de matériel réduites et de nouvelles stratégies de quantification
Langue Anglais
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Auteur : Moritz, Chloé
Date de soutenance : 09-11-2021

Directeur(s) de thèse : Carapito, Christine - Schaeffer-Reiss, Christine

Président : Pineau, Charles
Rapporteur(s) : Schilling, Oliver

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
École doctorale : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie analytique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Protéomique quantitative, Nanoprotéomique, NLC-IMS-MS/MS
Mots-clés :
  • Chimie analytique
  • Protéomique
Résumé : Ce travail de thèse porte sur l’étude des protéines à partir d’échantillons en contenant jusqu’à moins d’un microgramme. Il est axé sur l’évaluation de nouveaux protocoles de préparation d’échantillons et l’automatisation de l’un d’entre eux, la SP3. Des méthodes d’acquisitions en ddaPASEF et diaPASEF ont été évaluées grâce à un spectromètre de masse innovant possédant une dimension de séparation en mobilité ionique. Des outils bio-informatiques dédiés à la protéomique quantitative permettant de traiter ces données au format atypique ont été évaluées. Enfin, différentes stratégies analytiques ont été développées pour étudier les interactions protéine-protéine, afin de mieux appréhender les mécanismes d’accumulation du cholestérol et son rôle dans l’athérosclérose ainsi que d’étudier la biogénèse du ribosome et la régulation des ARNm. Enfin un dernier projet a permis d’évaluer l’impact de nanoparticules d’intérêt médical sur des cellules immunitaires humaines.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAF042
Type de ressource : Thèse