Exploration par chémographie des espaces chimiques ultra-larges pour la chimie médicinale
Langue Anglais
Accéder au document

Ce document est protégé en vertu du Code de la Propriété Intellectuelle.

 
Auteur : Zabolotna, Yuliana
Date de soutenance : 17-09-2021

Directeur(s) de thèse : Horvath, Dragos - Varnek, Alexandre

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Chimie de la matière complexe (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
 
Discipline : Chimie informatique et théorique
Classification : Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Chémoinformatique, Chémographie, Grands volumes de données en chimie, Visualisation de données, Exploration d'espaces chimique, QSAR, Produits naturels, Bibliothèques codées par AND, Building blocks
Mots-clés :
  • Chimie -- Informatique
  • Data visualisation
  • QSAR (biochimie)
  • Produits naturels
Résumé : Cette thèse est dédiée à l'analyse détaillée de l'espace chimique des chimiothèques ultra-larges à l’aide de l’approche GTM et au développement de ChemSpace Atlas – un outil en ligne conçu pour la navigation à travers des milliards de composés. L'efficacité et la polyfonctionnalité de la GTM ont permis de produire une image détaillée de l'espace chimique actuellement disponible pour les chimistes médicinaux. Plusieurs groupes de composés (fragment-, lead-, drug-, PPI- and NP-like, produits naturels, building blocks, et les bibliothèques codées par l'ADN) ont été systématiquement analysés à l'aide de la GTM hiérarchique. Les dizaines de milliers de cartes ainsi obtenues ont été utilisées comme base principale de l'atlas ChemSpace. Cet outil permet une exploration efficace de l'espace chimique ultra-large sous des angles différents : chimiotypes, diverses propriétés physicochimiques, activités biologiques, etc. En outre, la hiérarchie des cartes offre de multiples niveaux de détail : d'une vue globale de l'ensemble des données sur la carte universelle à la détection de motifs structurels dans des zones distinctes sur les cartes zoomées dédiées aux régions spécifiques.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAF054
Type de ressource : Thèse