Études structurales et biochimiques sur les complexes d'élongation de l'ARN polymérase liés aux facteurs de transcription NusG et NusA
Langue Anglais
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Auteur : Zhu, Chengjin
Date de soutenance : 26-02-2021

Directeur(s) de thèse : Weixlbaumer, Albert

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
École doctorale : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
 
Discipline : Biophysique et biologie structurale
Classification : Sciences de la vie, biologie, biochimie

Mots-clés libres : L’élongation & la terminaison de la transcription, NusG & NusA, Cryo-EM, La dynamique de l’ARNP
Mots-clés :
  • ARN polymérases
  • Élongation (biologie moléculaire)
  • Facteurs de transcription
Résumé : L'ARN-polymérase (ARNP) est l'enzyme clé de la transcription. Elle est étroitement régulée par des facteurs au cours du cycle de la transcription. Les deux facteurs NusA et NusG, ont un effet opposé sur la pause transcriptionnelle. Le but de ma thèse est d'utiliser la cryo-EM en analyse de particules isolées combinée à des analyses biochimiques pour mettre en évidence la régulation de l'ARNP par NusA et NusG, et ces deux facteurs ensemble. Nous démontrons que l'ARNP elle-même a un mouvement dynamique constant entre conformation non-pivotante et pivotante. NusA stabilise l'ARNP dans une conformation pivotante qui est proche de l'état de pause, alors que NusG favorise un état non-pivotant de l'ARNP. NusG-CTD est en compétition avec NusA sur un même site de liaison, le module Flap-Tip-Helix de l'ARNP. Les résultats biochimiques ont montré que NusA et NusG, compensent leurs effets et modulent la vitesse de transcription. Cependant, dans le contexte de la terminaison, rho-dépendante, NusA et NusG, ensemble pourraient augmenter l'efficacité de la terminaison précoce.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2021STRAJ107
Type de ressource : Thèse