Mélanges non-idéaux dans les bicouches phospholipidiques : approche dynamique moléculaire
Langue Anglais
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Auteur : Berezovska, Yelyzaveta
Date de soutenance : 12-12-2022

Directeur(s) de thèse : Thalmann, Fabrice

Président : Meyer, Hendrik
Rapporteur(s) : Loison, Claire - Callan-Jones, Andrew
Membre(s) du jury : Marques, Carlos Manuel

Établissement de soutenance : Strasbourg
Laboratoire : Institut Charles Sadron (Strasbourg ; 1985-....)
École doctorale : École doctorale Physique et chimie-physique (Strasbourg ; 1994-....)
 
Discipline : Physique
Classification : Physique, Sciences de la vie, biologie, biochimie, Chimie, minéralogie, cristallographie

Mots-clés libres : Bicouches lipidiques, Membranes, Facteur de structure, Réponse linéaire, Théorie de Kirkwood-Buff, Mélanges lipidiques, Théorie des solutions régulières, Simulations numériques, SPICA, LAMMPS
Mots-clés :
  • Mélanges (chimie)
  • Membranes lipidiques
  • Phospholipides
  • Dynamique moléculaire
Résumé : Les phospholipides sont des molécules amphiphiles qui s'auto-assemblent en bicouches dans l'eau et présentent des propriétés physiques et chimiques complexes et diverses en fonction de leur composition. Le rôle des lipides dans les membranes cellulaires est essentiel. La dynamique moléculaire permet d'étudier les structures des bicouches à des échelles nanométriques et picosecondes, qui sont soit difficiles soit impossibles à atteindre expérimentalement. Nous nous concentrons ici sur les propriétés thermodynamiques des mélanges lipidiques purs et binaires, en utilisant le champ de force lipidique à gros grains SPICA. En adaptant la théorie des solutions de Kirkwood-Buff à notre cas, nous analysons les fluctuations de densité dans l'espace réciproque (facteurs de structure) pour obtenir les paramètres thermodynamiques d'intérêt, tels que la compressibilité ou l'énergie libre de mélange dans une théorie de description régulière des solutions. Nous montrons ensuite comment relier en pratique les propriétés moléculaires des modèles lipidiques à gros grains aux propriétés thermodynamiques collectives du système macroscopique correspondant.
 
Type de contenu : Text
Format : PDF
 
Entrepôt d'origine : STAR : dépôt national des thèses électroniques françaises
Identifiant : 2022STRAE031
Type de ressource : Thèse