Note ABES Interaction des segments d’ARN génomique du virus Influenza A avec la nucléoprotéine virale NP : impact structural et implications pour l’encapsidation du génome Interaction of Influenza A genomic RNA segments with the viral nucleoprotein NP : structural impact and implications for genome packaging Activité chaperon ARN Cartographie chimique Influenza SHAPE Structure Chaperone activity RNA Chemical probing Influenza SHAPE Structure 572.8 572.6 Interactions ADN-protéine Influenzavirus A Empaquetage de l'ADN Les virus Influenza A possèdent un génome segmenté en 8 ARN génomiques, impliqués dans des épidémies saisonnières et des pandémies occasionnelles. La complexité de leur génome requiert un mécanisme afin d’empaqueter un exemplaire de chaque ARN viral, afin d’obtenir des particules virales infectieuses. L’empaquetage sélectif de ces ARN est régi par des interactions entre des signaux d’empaquetage présents sur les ARN génomiques. Leur accessibilité est régulée par la structure de l’ARN. Nous avons cherché à caractériser la liaison de la protéine NP à l’ARN, ainsi que l’impact de cette liaison sur la structure de l’ARN. A l’aide de techniques de cartographique chimique, nous avons montré que la NP ne reconnaissait pas de séquence spécifique et identifié de potentiels sites de fixation. Nous avons pu démontrer que l’étude de la structure de l’ARN permet d’identifier des signaux d’empaquetage ainsi que les interactions entre deux segments complexés modifient la structure de ces segments. Influenza A viruses have a segmented genome of 8 genomic RNAs, involved in seasonal epidemics and occasional pandemics. The complexity of their genome requires a mechanism to package one copy of each viral RNA into infectious virus particles.The selective packaging of these RNAs is governed by interactions between packaging signals on the genomic RNAs. Their accessibility is regulated by the structure of the RNA.We sought to characterize the binding of the NP protein to RNA, and the impact of this binding on RNA structure. Using chemical probing techniques, we showed that the NP does not recognize a specific sequence and identified potential binding sites. We were able to demonstrate that the study of the RNA structure allows the identification of packaging signals and that interactions between two complexed segments modify the structure of these segments. Electronic Thesis or Dissertation Text fr PDF 50830637 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-04047015 application/pdf 50819963 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2022/QUIGNON_Erwan_2022_ED414.pdf http://www.theses.fr/2022STRAJ039/abes https://theses.hal.science/tel-04047015 https://theses.hal.science/tel-04047015 https://theses.hal.science/tel-04047015 https://theses.hal.science/tel-04047015 Quignon Erwan 1995-07-12 FR 257783024 1206008747Y 21602361 4200047 https://theses.fr/2022STRAJ039 2022STRAJ039 https://doi.org/10.70675/6746cc3fze21az4137z84b2z81ec1a9e1084 2022-09-02 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Marquet Roland MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 060810319 Dimitrova Maria MADS_PRESIDENT_DU_JURY 204203112 Munier Sandie MADS_RAPPORTEUR_1 110998642 Volmer Romain MADS_RAPPORTEUR_2 122818687 École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 157545687 93780 ddc:570 Marquet Roland Dimitrova Maria Munier Sandie Volmer Romain École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg) PDF 50830637