Note ABES Study of the role of the cyclin-dependent kinase inhibitor p21Waf1/Cip1 in cellular senescence Étude du rôle de l’inhibiteur de kinase cycline-dépendante p21Waf1/Cip1 dans la sénescence cellulaire Sénescence P21 Cdkn1a RNA-seq Interactome Knock-down Peroxysome Cytokine Irradiation Senescence P21 Cdkn1a RNA-seq Interactome Knock-down Peroxisome Cytokine Irradiation 572.7 571.6 Inhibiteurs des kinases dépendantes des cyclines Transcription génétique Cellules Vieillissement Effets physiologiques La sénescence cellulaire est un état d'arrêt de prolifération irréversible avec des nombreuses altérations cellulaires qui ont un impact important sur la santé. Parmi ses multiples activités, l'inhibiteur de la kinase cycline-dépendante p21 médie l'arrêt du cycle cellulaire au début de la réponse sénescent. L'objectif de ce projet est de découvrir et d'explorer des fonctions alternatives de p21 dans la sénescence. Pour ce faire, les niveaux de p21 ont été diminués dans des fibroblastes sénescentes induites par irradiation, dérivés d'un modèle murin inductible p21-knock-down. L'analyse de RNA-seq impliquais p21 dans la régulation transcriptionnelle du cycle cellulaire, des peroxysomes, de la traduction et de la sécrétion de cytokines dans la sénescence, entre autres. Certaines de ces fonctions ont été explorées par d'autres approches expérimentales. De plus, l'interactome de p21 dans les cellules sénescentes a été obtenu et identifié par co-immunoprécipitation et spectrométrie de masse. Cellular senescence is a state of irreversible proliferation arrest accompanied by alterations at all cellular levels that impacts many physiological and pathological processes. Among its multiple activities, the cyclin-dependent kinase inhibitor p21 is an important senescence marker which mediates the cell cycle arrest at early phases of the response. The goal of this project was to uncover and explore alternative functions of p21 in senescence. To do so, p21 levels were decreased in fully senescent cells induced by irradiation using primary fibroblasts derived from an inducible p21-knock-down mouse modeI. Bulk-RNA-seq analysis implicated p21 in the transcriptional regulation of the cell cycle, peroxisomes, translation or cytokine secretion in senescence, among others. Some of these functions were further explored using other experimental approaches. Additionally, the interactome of p21 in senescent cells was obtained by co-immunoprecipitation and identified by mass spectrometry. Electronic Thesis or Dissertation Text en PDF 147123475 Université de Strasbourg Strasbourg 2023-12-31 https://theses.hal.science/tel-04013530 application/pdf 55333557 https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2022/ZAPATABODALO_Irene_2022_ED414.pdf http://www.theses.fr/2022STRAJ044/abes https://theses.hal.science/tel-04013530 https://theses.hal.science/tel-04013530 Zapata Bodalo Irene 1990-02-21 FR 264865197 0EFB1S071N5 21724059 4200047 http://www.theses.fr/2022STRAJ044 2022STRAJ044 2022-09-15 Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 131056549 Doctorat Docteur es non oui Keyes William M. MADS_DIRECTEUR_DE_THESE_1 240793668 Charvin Gilles MADS_PRESIDENT_DU_JURY 089060792 Li Han MADS_RAPPORTEUR_1 242813704 Martin Nadine MADS_RAPPORTEUR_2 23238178X École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) MADS_ECOLE_DOCTORALE_1 414 156502844 Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) MADS_PARTENAIRE_DE_RECHERCHE_1 155263749 93800 ddc:570 Keyes William M. Charvin Gilles Li Han Martin Nadine École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) PDF 147123475